2

我想提取特定列的值<0.05的文件行。

例如，如果 $2 或 $4 或 $6 的值 <0.05，那么我想将该行发送到新文件。我不希望任何这些列中的值 >0.05 的任何行

cat File_1.txt 
S_003   P_003   S_006   P_006   S_008   P_008
74.9    0.006   59.6    0.061   72.2    0.002
96.2    0.003   89.4    0.001   106.9   0.000
105.8   0.003   72.6    0.003   86.7    0.002
45.8    0.726   38.5    0.981   43.9    0.800
50.7    0.305   47.8    0.314   46.6    0.615
49.9    0.366   50.4    0.165   48.2    0.392
42.5    0.920   43.7    0.698   40.3    0.970
46.3    0.684   42.9    0.760   47.7    0.438
192.4   0.001   312.8   0.001   274.3   0.001

我使用 awk 进行了尝试，但它只能在很长的时间内完成。

awk ' $2<=0.05' file_1.txt > file_2.txt
awk ' $4<=0.05' file_2.txt > file_3.txt

等，并达到了预期的结果

96.2    0.003   89.4    0.001   106.9   0.000
105.8   0.003   72.6    0.003   86.7    0.002
192.4   0.001   312.8   0.001   274.3   0.001

但我的文件是 198 列和 57000 行

我还尝试将 awk 命令连接在一起，但没有运气。它只搜索 $2

awk ' $2<=0.05 || $4=<0.05' File_1.txt > File_2.txt

74.9    0.006   59.6    0.051   72.2    0.002
96.2    0.003   89.4    0.001   106.9   0.000
105.8   0.003   72.6    0.003   86.7    0.002
192.4   0.001   312.8   0.001   274.3   0.001

我对此很陌生，如果有任何关于如何使用 awk 实现这一点的建议，我将不胜感激

谢谢

山姆

4

1 回答 1

2

也许这就是你要找的。它将搜索每个偶数列并检查这些列中的每一列是否包含小于“0.05”的数字：

awk 'NF>1 { for(i=2;i<=NF;i+=2) if ($i>0.05) next }1' File_1.txt

结果：

96.2    0.003   89.4    0.001   106.9   0.000
105.8   0.003   72.6    0.003   86.7    0.002
192.4   0.001   312.8   0.001   274.3   0.001
于 2012-12-18T05:58:32.350 回答