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我的数据或多或少看起来像这样(不知道如何粘贴图表):

library(reshape2)
library(ggplot2)

df <- cbind(runif(2000,0,1000), rep(0,n=2000))
for (i in 1:nrow(df)) {
  df[i,2] <- runif(1, df[i,1], (10000-2*df[i,1])) 
}
colnames(df) <- c("x","y")
df.1 <- melt(data.frame(df), id="x")

p <- ggplot(df.1, aes(x=x, y=value))
p <- p + geom_point()
p <- p + geom_smooth()
p

我需要一条位于底部 5% 的直线和一条位于顶部 95% 的直线,而不是显示的平滑线。一个问题是我有数百万分,所以我认为 data.table 是一个很好的前进方向:

library(data.table)
dt <- data.table(df)
dt[,xbin:=0]
for (i in 0:100) {
  x1 <- i*100
  x2 <- (i+1)*100
  dt[x>=x1 & x<x2, xbin:=x2]
}
setkey(dt,xbin)
result1.dt <- dt[,list(ymin=min(y), ymax=max(y)), by=key(dt)]
result1.df <- data.frame(result1.dt)

p <- p + geom_line(data=result1.df, aes(x=xbin, y=ymin))
p <- p + geom_line(data=result1.df, aes(x=xbin, y=ymax))
p

线条还不是笔直的,但从这里修复它是微不足道的。

而不是最小值和最大值,我如何使用 data.table 获得第 5 个和第 95 个百分位数?我是否在重新发明轮子,即是否已经有一个统计方法(和一个函数)?

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您可以使用stat_quantile将这些线添加到您的绘图中。

p + stat_quantile(quantiles = c(0.05,0.95))

在此处输入图像描述

这使用分位数回归,特别是包中的rq函数quantreg

于 2012-12-18T03:28:59.973 回答
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p <- p + geom_line(aes(x=c(0,1000), y= quantile(df[,"y"], prob=0.05) ) )
p+geom_line(aes(x=c(0,1000), y= quantile(df[,"y"], prob=0.95) ) )

评论:我更喜欢@mnel 的版本,尽管它可能不是你想要的。

于 2012-12-18T03:36:22.933 回答