r - ggplot2 0.9.3 的异常行为

Question

此代码无法按预期工作ggplot2 0.9.3（适用于早期版本的 ggplot2，请参见此处）。这个问题有解决方法吗？

library(ggplot2)
p <- qplot(as.factor(dose), len, data=ToothGrowth, geom = "boxplot", color = supp) + theme_bw()
p <- p + labs(x="Dose", y="Response")
p <- p + stat_summary(fun.y = mean, geom = "point", color = "blue", aes(group=supp))
p <- p + stat_summary(fun.y = mean, geom = "line", aes(group = supp))
p <- p  + theme(axis.title.x = element_text(size = 12, hjust = 0.54, vjust = 0))
p <- p  + theme(axis.title.y = element_text(size = 12, angle = 90,  vjust = 0.25))
print(p)

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这条线

p <- p + stat_summary(fun.y = mean, geom = "line", aes(group = supp))

产生以下警告

geom_path：每个组仅包含一个观察值。需要调整群体审美吗？

Answer 1

这种行为是 ggplot2 0.9.3 中的一个错误：https ://github.com/hadley/ggplot2/issues/739

您可以通过使用 ddply 计算摘要来解决它：

library(plyr)
tg <- ddply(ToothGrowth, c("dose", "supp"), summarise, len = mean(len))

library(ggplot2)
ggplot(ToothGrowth, aes(x=as.factor(dose), y=len, colour=supp)) +
    geom_boxplot() +
    geom_line(data=tg, aes(group=supp))