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我正在绘制一张地图，其中包含不同的疟疾寄生虫耐药性研究地点。研究地点的点的大小与采样的疟原虫数量相关，并且这些点的填充是从 0 到 1 的具有耐药性的疟原虫比例的梯度。以下代码显示了下面的地图：

###GENERATING AFRICA MAP###
africa = readOGR("/Users/transfer/Documents/Mapping Files/Africa Countries/Africa_SHP",    layer="dissolved")
#FIXING THE NON-NODED INTERSECTS#
africa = gBuffer(africa, width=0, byid=TRUE)
#CREATING DATA FRAME FOR GGPLOT#
africa.map = fortify(africa, region="ID")

###PLOTTING SPM.437###
#SCALING THE SAMPLE SIZE USING CUBE-ROOT#
size = d.spm.437$Tot437^(1/3)
#PLOTTING#
ggplot(africa.map, aes(x = long, y = lat, group = group)) + 
    geom_polygon(colour="black",   size=0.25, fill="white", aes(group=group)) +
    geom_point(data = d.spm.437, aes(x = long, y = lat, fill=Frc437, group=NULL, size=Tot437), 
        size=size, shape=21, colour="black", size=0.5)

在此处输入图像描述

我尝试使用颜色选项，但它不起作用：

ggplot(africa.map, aes(x = long, y = lat, group = group)) + 
    geom_polygon(colour="black",   size=0.25, fill="white", aes(group=group)) +
    geom_point(data = d.spm.437, aes(x = long, y = lat, colour="red", fill=Frc437, group=NULL, size=Tot437), 
        size=size, shape=21, colour="black", size=0.5)

任何人都知道如何让填充的颜色显示红色的比例，较浅的为 0，较暗的为 1？

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正如我在评论中提到的，我认为您对设置与映射美学有点困惑。

您将美学映射到aes(). 因此，aes(color = var)将颜色美学映射到变量 var，您会得到一个图例来显示颜色如何随 var 变化。如果您将之外的颜色设置aes()为单一值，那么您只是将所有点设置为单一颜色：color = "red"。

我怀疑你感到困惑的原因是你有size=Tot437inside of aes()，然后既有 size=size又有size=0.5外部aes()。

最后，要更改调色板，您需要了解scale_color_*功能（以及scale_fill_*, scale_size_*等）。这是一个简单的示例，可以帮助您入门：

dat <- data.frame(x = rnorm(50),
                  y = rnorm(50),
                  f = runif(50))

library(ggplot2)
library(munsell)
cl <- mnsl(c("5R 2/4", "5R 7/10"))

ggplot(dat,aes(x,y,fill = f)) + 
    geom_point(size = 5,shape = 21) + 
    scale_fill_gradient(low = cl[1],high = cl[2])

我是怎么想出那种看起来很疯狂的颜色规格的？只是从前几行开始scale_fill_continuous，然后在 munsell 包中闲逛了一下。

编辑：我完全错过了你实际使用的pch = 21基本上是唯一的点形状，而fill美学是有意义的，所以我编辑删除了我对这个分数的评论。

于 2012-12-07T18:32:52.880 回答