1

如何获得预期的输出

rank 0
size 2
rank 1
size 2

或者这些线的一些排列？

ranktest.c

#include <mpi.h>
#include <stdio.h>
int main(int argc, char *argv[]){
    MPI_Init(NULL, NULL);
    int world_rank;
    MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD, &world_rank);
    int world_size;
    MPI_Comm_size(MPI_COMM_WORLD, &world_size);
    printf("rank %d\n", world_rank);
    printf("size %d\n", world_size);
    MPI_Finalize();
    return 0;
}

编译和运行

tsbertalan@hustlenbustle:~$ mpicc ranktest.c
tsbertalan@hustlenbustle:~$ mpirun -np 2 ./a.out 
rank 0
size 1
rank 0
size 1

在不同的主机上：

tsbertalan@stamp:~$ mpicc ranktest.c
tsbertalan@stamp:~$ mpirun -np 2 ./a.out 
rank 0
size 2
rank 1
size 2

我试过了

tsbertalan@hustlenbustle:~$ sudo aptitude reinstall openmpi-bin libopenmpi-dev

但没有任何改变。/etc/openmpi/openmpi-default-hostfile 和 /etc/openmpi/openmpi-mca-params.conf 都只包含对两个主机的注释。这里可能有什么不同？

更改为MPI_Init(&argc, &argv)或 或者，int main()也不会执行任何操作。

真正的问题，感谢 user3469194：

linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude remove libopenmpi-dev mpich2
linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude install libmpich2-dev openmpi-bin
linuxmint@linuxmint ~ $ mpicc ranktest.c
linuxmint@linuxmint ~ $ mpirun -np 2 ./a.out
rank 0
size 1
rank 0
size 1
linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude remove libmpich2-dev openmpi-bin
linuxmint@linuxmint ~ $ sudo aptitude install libopenmpi-dev mpich2
linuxmint@linuxmint ~ $ mpicc ranktest.c
linuxmint@linuxmint ~ $ mpirun -np 2 ./a.out
[linuxmint:16539] [[INVALID],INVALID] ORTE_ERROR_LOG: A system-required executable either could not be found or was not executable by this user in file ../../../../../../orte/mca/ess/singleton/ess_singleton_module.c at line 357

（还有更多）

对一些建议的回应：（ 请参阅此 github 存储库，2012 年 12 月 1 日提交。）

尝试在 MPI_Init() 之前移动 world_rank 和 world_size 的定义，它会改变什么吗？

自然，这不太好用：

tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ git checkout 7b5e229 ranktest.c
(reverse-i-search)`clean': tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ make ^Cean && make ranktest && mpirun -np 2 ranktest
tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ make clean && make ranktest && mpirun -np 2 ranktest
rm -f heat_serial heat_omp heat_mpi heat_serial_O* ranktest
mpicc ranktest.c -o ranktest
*** An error occurred in MPI_Comm_rank
*** before MPI was initialized
*** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (your MPI job will now abort)
[perrin:15206] Abort before MPI_INIT completed successfully; not able to guarantee that all other processes were killed!
*** An error occurred in MPI_Comm_rank
*** before MPI was initialized
*** MPI_ERRORS_ARE_FATAL (your MPI job will now abort)
[perrin:15207] Abort before MPI_INIT completed successfully; not able to guarantee that all other processes were killed!
tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ git checkout HEAD ranktest.c

或者，在我的家用电脑上：

tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ git checkout 7b5e229 ranktest.c
tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ vim ranktest.c 
tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ make clean && make ranktest && mpirun -np 2 ranktest
rm -f heat_serial heat_omp heat_mpi heat_serial_O* ranktest
mpicc ranktest.c -o ranktest
Attempting to use an MPI routine before initializing MPICH
Attempting to use an MPI routine before initializing MPICH
tsbertalan@hustlenbustle:~/Documents/School/12fall2012/524apc524/hw/hw4$ git checkout HEAD ranktest.c

这几乎总是将一个使用一个 MPI 编译的程序与另一个的 mpirun 一起运行的问题。第一台机器（hustlenbustle）是否也安装了 mpich2？事物出现在路径的什么位置？特别是 和 的结果是which mpicc什么which mpirun？

我在每次尝试之前在每台计算机上重新编译。我继续为此制定了目标。但是，根据要求：

tsbertalan@hustlenbustle:~$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
tsbertalan@hustlenbustle:~$ which mpirun
/usr/bin/mpirun

tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ which mpicc
/usr/bin/mpicc
tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ which mpirun
/usr/bin/mpirun

而且，对于 shiggles，这里是 hnb 和 perrin 的一些 aptitude搜索的输出。让我知道我是否应该搜索其他内容。

在 Open MPI 下，以下命令应打印出版本：mpirun -V. 如果它不打印mpiexec (OpenRTE) 1.x.x.，那么您可能有运行时间不匹配。

tsbertalan@hustlenbustle:~$ mpirun -V
mpirun (Open MPI) 1.4.3

tsbertalan@perrin:~/svn/524hw4$ mpirun -V
mpirun (Open MPI) 1.4.1

但是，我正在为每个测试重新编译。

也许sudo aptitude reinstall SOMETHING会有所帮助？

4

2 回答 2

1

我也有这个问题。问题是 mpicc 是 OpenMPI（要看到这个，只需运行 mpicc -v），而 mpirun 是 MPICH2（mpirun -V）。我只是通过卸载 MPICH2 来解决它。

于 2014-03-27T15:10:53.757 回答
1

在我计算机上的 mpic.c 版本中找到了此代码（当我安装了一个带有 mpi 的新软件包时，这给我带来了麻烦）。您的计算机上似乎有类似的东西，而另一台主机的版本正确。

int MPI_Comm_rank( MPI_Comm comm, int *rank)
{
  *rank=0;
  return 0;
}

如您所见，rank 始终设置为 0（类似的 size 函数可能将变量设置为 1）。

于 2013-08-06T22:48:28.293 回答