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我用 Python 编写了一个分析管道,我认为它对其他人有用。我想知道是否习惯在 GitHub 上发布此类脚本,是否有专门的地方可以为 Python 脚本执行此操作,或者是否有更具体的地方可以放置与生物学相关的 Python 脚本。

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虽然有很多方法可以解决这个问题,但其中一种习惯性的解决方案是确实将其发布在 github 上,然后从您的研究机构的网站链接到它。

于 2012-11-13T03:57:22.747 回答
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您也可以在sourceforge上发布它。发布了所有类型的科学、工程等脚本,数以百万计的人下载这些脚本。Github 也是一个不错的选择,但我确实相信sourceforge在观众和下载中更受欢迎。另外,你可以发布一个openwetware wiki 并在那里发布代码,openwetware 是一个科学使用的 wiki 系统,我以前使用过并推荐它。或者你可以通过镜像链接两个伟大的开源平台,sourceforge 和 github,这样你的项目基本上“同步”到两个平台:检查一下:

http://www.17od.com/2010/11/11/migrating-a-sourceforge-subversion-repository-to-github/ -overview http://www.xcore.com/forum/viewtopic.php?f= 3&t=162 - 如何实际镜像

于 2012-11-13T04:05:52.470 回答
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另一种选择是将其发布在bioinformatics.org上。

于 2012-11-13T04:11:16.613 回答
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另见“关于在 Github 上保存已发布的生物信息学代码”

于 2012-11-13T07:20:13.407 回答