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我有这个ggplot

ggplot(dt.1, aes(x=pctOAC,y=NoP, fill=Age)) +
    geom_bar(stat="identity",position=position_dodge()) +
    geom_smooth(aes(x=pctOAC,y=NoP, colour=Age), se=F, method="loess",show_guide = FALSE,lwd=0.7) +
    theme(legend.position=c(.2,0.8))

在此处输入图像描述

dt1 <- structure(list(Age = structure(c(1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 1L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L, 2L), .Label = c("o80", "u80"), class = "factor"), NoP = c(47L, 5L, 33L, 98L, 287L, 543L, 516L, 222L, 67L, 14L, 13L, 30L, 1L, 6L, 17L, 30L, 116L, 390L, 612L, 451L, 146L, 52L), pctOAC = c(0, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100, 0, 10, 20, 30, 40, 50, 60, 70, 80, 90, 100)), .Names = c("Age", "NoP", "pctOAC"), row.names = c(NA, -22L), class = "data.frame")

我希望将平滑线限制在零以上,也许类似于内核密度。事实上,如果我基础数据,我希望内核密度正是我想要的,但我只有聚合数据。有没有办法做到这一点?我尝试在 中使用不同method=geom_smooth,但小数据集似乎阻止了它。我想知道如何使用stat_function,但我对如何继续寻找合适的绘图函数没有太多线索。

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另一种可能性是使用method="glm"样条曲线和日志链接(即也尝试过method="gam",但它的自动复杂性调整希望减少太多的摆动:

library(splines)
ggplot(dt.1, aes(x=pctOAC,y=NoP, fill=Age)) +
    geom_bar(stat="identity",position=position_dodge()) +
    geom_smooth(aes(colour=Age), se=F,
                method="glm",
                formula=y~ns(x,8),
                family=gaussian(link="log"),
                show_guide = FALSE,lwd=0.7) +
    theme(legend.position=c(.2,0.8))

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于 2012-11-03T21:09:31.380 回答
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怎么样geom_density()

ggplot(dt1, aes(x=pctOAC,y=NoP, colour=Age, fill=Age)) +
  geom_bar(stat="identity",position=position_dodge()) +
  geom_density(stat="identity", fill=NA) +
  theme(legend.position=c(.2,0.8))

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于 2012-11-03T21:07:57.730 回答