matlab - 是否可以在没有分布式计算引擎的情况下访问 MATLAB 中的 MPI 功能

Question

我可以访问运行 Torque 的集群，但不能选择安装 MATLAB 分布式计算引擎。我想知道是否可以在 MATLAB 中使用 MPI 命令而无需分布式数组等额外功能。如果您没有分布式计算引擎，是否可以将 MATLAB lab* 命令与 mpirun 命令结合使用？

Answer 1

如果您的 MPI 实现是 Open MPI，您可以使用 Poor Man's Parallel Toolbox (tm)，它允许您在许多节点上并行运行许多 MATLAB 实例，并让它们中的每一个执行不同的操作，例如运行不同的脚本。成功的关键在于 Open MPI 会在环境变量中导出当前进程的等级，OMPI_COMM_WORLD_RANK并且可以使用一个简单的 shell 脚本来环绕执行。这是一个示例：

#!/bin/bash

file_num=script$(printf "%03d" $(($OMPI_COMM_WORLD_RANK + 1))).m
matlab < $file_num

可以将其启动为：

mpiexec -np 24 ./script.sh

这将启动 24 个 MATLAB 副本，每个副本都接收来自不同脚本的输入。第一个将从 获取命令script001.m，第二个从获取命令script002.m，依此类推。

当然，您总是可以用 C 或 C++ 甚至 Fortran 编写并行代码，并在那里使用 MPI。然后将代码编译成一个共享库，可从 MATLAB 加载和调用。