我想将我的聚类算法专门应用于蛋白质-蛋白质相互作用（PPI）网络。为此，我需要一个带有参考的基准数据集，以便我可以验证我的结果。任何建议都将不胜感激。
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我建议您阅读van Brohee 和 van Helden对蛋白质-蛋白质相互作用网络的聚类算法的评估( http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/17087821 )。我认为他们的基准数据是可用的，并且他们在避免比较聚类算法和/或黄金标准时存在的许多陷阱方面做得非常好。
于 2012-10-22T08:28:01.940 回答