您的选择
order
从base
arrange
从dplyr
setorder
并setorderv
从data.table
arrange
从plyr
sort
从taRifx
orderBy
从doBy
sortData
从Deducer
大多数时候你应该使用dplyr
ordata.table
解决方案,除非没有依赖关系很重要,在这种情况下使用base::order
.
我最近将 sort.data.frame 添加到 CRAN 包中,使其类兼容,如下所述:
为 sort.data.frame 创建通用/方法一致性的最佳方法?
因此,给定data.frame dd,可以按如下方式排序:
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
library(taRifx)
sort(dd, f= ~ -z + b )
如果您是此功能的原作者之一,请与我联系。关于公共领域的讨论在这里:https ://chat.stackoverflow.com/transcript/message/1094290#1094290
您还可以使用Hadley 在上述线程中指出的arrange()
函数:plyr
library(plyr)
arrange(dd,desc(z),b)
基准测试:请注意,我在新的 R 会话中加载了每个包,因为存在很多冲突。特别是加载 doBy 包会导致sort
返回“以下对象被'x(位置 17)'屏蔽:b、x、y、z”,并sort.data.frame
从 Kevin Wright 或 taRifx 包中加载 Deducer 包。
#Load each time
dd <- data.frame(b = factor(c("Hi", "Med", "Hi", "Low"),
levels = c("Low", "Med", "Hi"), ordered = TRUE),
x = c("A", "D", "A", "C"), y = c(8, 3, 9, 9),
z = c(1, 1, 1, 2))
library(microbenchmark)
# Reload R between benchmarks
microbenchmark(dd[with(dd, order(-z, b)), ] ,
dd[order(-dd$z, dd$b),],
times=1000
)
中位时间:
dd[with(dd, order(-z, b)), ]
778
dd[order(-dd$z, dd$b),]
788
library(taRifx)
microbenchmark(sort(dd, f= ~-z+b ),times=1000)
中位时间:1,567
library(plyr)
microbenchmark(arrange(dd,desc(z),b),times=1000)
中位时间:862
library(doBy)
microbenchmark(orderBy(~-z+b, data=dd),times=1000)
中位时间:1,694
请注意,doBy 需要花费大量时间来加载包。
library(Deducer)
microbenchmark(sortData(dd,c("z","b"),increasing= c(FALSE,TRUE)),times=1000)
无法加载 Deducer。需要 JGR 控制台。
esort <- function(x, sortvar, ...) {
attach(x)
x <- x[with(x,order(sortvar,...)),]
return(x)
detach(x)
}
microbenchmark(esort(dd, -z, b),times=1000)
由于附加/分离,似乎与微基准不兼容。
m <- microbenchmark(
arrange(dd,desc(z),b),
sort(dd, f= ~-z+b ),
dd[with(dd, order(-z, b)), ] ,
dd[order(-dd$z, dd$b),],
times=1000
)
uq <- function(x) { fivenum(x)[4]}
lq <- function(x) { fivenum(x)[2]}
y_min <- 0 # min(by(m$time,m$expr,lq))
y_max <- max(by(m$time,m$expr,uq)) * 1.05
p <- ggplot(m,aes(x=expr,y=time)) + coord_cartesian(ylim = c( y_min , y_max ))
p + stat_summary(fun.y=median,fun.ymin = lq, fun.ymax = uq, aes(fill=expr))
(线从下四分位数延伸到上四分位数,点是中位数)
鉴于这些结果并权衡简单性与速度,我不得不arrange
在plyr
包装中点头。它具有简单的语法,但几乎与带有复杂机制的基本 R 命令一样快。通常出色的哈德利·威克姆(Hadley Wickham)作品。我唯一的抱怨是它打破了标准 R 命名法,其中排序对象被调用sort(object)
,但我理解为什么 Hadley 这样做是由于上面链接的问题中讨论的问题。