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我一直试图在堆积条形图/面积图的组合上重新创建这篇文章。不过，我有一些缺失值的问题。

这是我的数据：https ://www.dropbox.com/sh/pnkspwnn1qslm6u/JapTKCwqMS

我跑的是；

    wa=read.table('wa_class.txt', sep="", header=F, na.string="0")
    names(wa)=c("Class","Jan","Feb","Mar","Apr","May","Jun","Jul","Aug","Sep","Oct","Nov","Dec")
    wam=melt(wa)
wam$variablen=as.numeric(wam$variable)

它看起来如何 

    > head(wam)
                   Class variable     value variablen
1         Actinobacteria      Jan 38.115163         1
2          Flavobacteria      Jan        NA         1
3        Sphingobacteria      Jan  3.640469         1
4    Alphaproteobacteria      Jan 13.631663         1
5 Betaproteobacteria_b28      Jan  3.718671         1
6     Betaproteobacteria      Jan 14.732354         1

ggplot(na.omit(wam[,c("Class","value","variablen")]), aes(wam,x=variablen, y=value, fill=Class)) + geom_area(color="black") + geom_linerange(aes(ymax=value), position="stack") + scale_x_continuous(breaks=1:max(wam$variablen)) + labs(title="Water", x="Month", y="Relative abundance (%)")

...所以我尝试在我绘制的变量上使用 na.omit 来纠正缺失值。但是，我在图中得到了例如相互覆盖的图层（请参阅保管箱文件夹）。

我找到了这篇文章（见保管箱文件夹），它纠正了它，但似乎只有一个。而且我无法重现它，因为指向数据的链接已经失效。

任何帮助将不胜感激！

谢谢，

乔

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1 回答 1

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一种解决方案是将零读取为零值。如果你不使用na.string="0"，情节将如下所示：

在此处输入图像描述

于 2012-10-12T08:41:42.980 回答