bioperl - 使用 bioperl 从 GFF3 数据库中获取属性值

Question

我已经使用 BioPerl 存储对象 (BIO:DB:SeqFeature:Store) 创建了一个 GFF3 DB 我自己从 Blastx 结果创建了 GFF3 文件，并创建了一系列我自己的标签作为属性。现在我将从 BioPerl 为我创建的数据库中获取这些值......

我该怎么做？

请帮忙！十分感谢。

Answer 1

我发现包中存在执行此操作的函数BIO::SeqFeature::Generic。最有用的是get_tag_values返回一个数组，其中每个值包含在属性中，并在输入中给出特定标签！

用法：

my @values= $feature->get_tag_values('go');

再见！