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我有一个列表，p其中的每个元素p都是 ggplot2 绘图对象的列表。

我想输出一个包含所有图的单个 pdf，其中p的图在p[[1]]第 1 页，图在p[[2]]第 2 页，等等。我该怎么做？

下面是一些示例代码，为您提供我正在使用的数据结构——为无聊的情节道歉，我随机选择了变量。

require(ggplot2)
p <- list()

cuts <- unique(diamonds$cut)
for(i in 1:length(cuts)){
    p[[i]] <- list()
    dat <- subset(diamonds, cut==cuts[i])
    p[[i]][[1]] <- ggplot(dat, aes(price,table)) + geom_point() + 
        opts(title=cuts[i])
    p[[i]][[2]] <- ggplot(dat, aes(price,depth)) + geom_point() + 
        opts(title=cuts[i])
}
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8 回答 8

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该解决方案与列表中列表的长度是否p不同无关。

library(gridExtra)

pdf("plots.pdf", onefile = TRUE)
for (i in seq(length(p))) {
  do.call("grid.arrange", p[[i]])  
}
dev.off()

由于onefile = TRUE该功能pdf将所有按顺序出现的图形保存在同一文件中（一个图形一页）。

于 2012-09-02T12:09:31.687 回答
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这是 Sven 解决方案的更简单版本，适用于 R 初学者，否则他们会盲目使用他们既不需要也不理解的 do.call 和嵌套列表。我有经验证据。:)

library(ggplot2)
library(gridExtra)

pdf("plots.pdf", onefile = TRUE)
cuts <- unique(diamonds$cut)
for(i in 1:length(cuts)){
    dat <- subset(diamonds, cut==cuts[i])
    top.plot <- ggplot(dat, aes(price,table)) + geom_point() + 
        opts(title=cuts[i])
    bottom.plot <- ggplot(dat, aes(price,depth)) + geom_point() + 
        opts(title=cuts[i])
    grid.arrange(top.plot, bottom.plot)
}
dev.off()
于 2014-05-16T03:14:52.773 回答
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ggplot2::ggsave()这是使用和将 ggplot 对象列表导出到单个 pdf 文件的最优雅的解决方案gridExtra::marrangeGrob()。

library(ggplot2)
library(gridExtra)

假设您使用创建多个图lapply()

p <- lapply(names(mtcars), function(x) {
  ggplot(mtcars, aes_string(x)) + 
    geom_histogram()
})

保存p地块列表：

ggsave(
   filename = "plots.pdf", 
   plot = marrangeGrob(p, nrow=1, ncol=1), 
   width = 15, height = 9
)
于 2020-04-30T20:22:57.940 回答
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我已经尝试了其中一些解决方案，但没有成功。我进行了更多研究，并找到了一个非常适合我的解决方案。它将我所有的图形保存在一个 pdf 文件中，每个图表在一页上。

library(ggplot2)


pdf("allplots.pdf",onefile = TRUE)
for(i in glist){
   tplot <- ggplot(df, aes(x = as.factor(class), y = value))
   print(tplot)
}
dev.off()
于 2018-12-10T02:19:13.633 回答
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这是一种解决方案，但我不是特别喜欢它：

ggsave("test.pdf", do.call("marrangeGrob", c(unlist(p,recursive=FALSE),nrow=2,ncol=1)))

问题在于它依赖于每组中的地块数量相同。如果all(sapply(p, length) == 2)是假的，那么它就会破裂。

于 2012-09-02T08:14:14.050 回答
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一个对我有用的解决方案ggpubr（Github 上的包，安装代码：）devtools::install_github("kassambara/ggpubr")。

假设您有 4 个图 p1、p2、p3 和 p4。

library(ggpubr)
multi.page <- ggarrange(p1,p2,p3,p4, nrow=1, ncol=1) # for one plot per page
multi.page[[1]] # for seeing the first plot
ggexport(multi.page, filename="my-plots.pdf")

更多使用示例：http ggpubr: //www.sthda.com/english/articles/24-ggpubr-publication-ready-plots/81-ggplot2-easy-way-to-mix-multiple-graphs-on-the-same -页/

于 2020-04-07T11:04:36.777 回答
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这是一个基于 Sven 方法的函数，包括roxygen2文档和一个示例。

#' Save list of ggplot2 objects to single pdf
#'
#' @param list (list) List of ggplot2 objects.
#' @param filename (chr) What to call the pdf.
#'
#' @return Invisible NULL.
#' @export
#'
#' @examples
#' #plot histogram of each numeric variable in iris
#' list_iris = map(names(iris[-5]), ~ggplot(iris, aes_string(.)) + geom_histogram())
#' #save to a single pdf
#' GG_save_pdf(list_iris, "test.pdf")
GG_save_pdf = function(list, filename) {
  #start pdf
  pdf(filename)

  #loop
  for (p in list) {
    print(p)
  }

  #end pdf
  dev.off()

  invisible(NULL)
}
于 2018-08-14T17:53:14.210 回答
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没有包的一个很好的解决方案gridExtra：

library(plyr)
library(ggplot2)

li = structure(p, class = c("gglist", "ggplot"))
print.gglist = function(x, ...) l_ply(x, print, ...)
ggsave(li, file = "test.pdf")
于 2018-05-14T07:56:21.530 回答