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在我重新编译我的 (C) 程序后，一些节点正在运行旧的编译（调试信息仍在其中），一些节点正在运行新的副本。服务器运行的是 Gentoo Linux，所有节点都从同一个存储中获取文件。我被告知文件系统是 NFS。我使用的 MPI 是 MPICH 版本 1.2.7。为什么有些节点不使用新编译的副本？

更多详细信息（以防您无法入睡）：

我正在尝试创建我的第一个 MPI 程序（我也是 C 和 Linux 的新手）。我的代码中有以下内容：

#if DEBUG
  {
    int i=9;
    pid_t PID;
    char hostname[256];
    gethostname(hostname, sizeof(hostname));
    printf("PID %d on %s ready for attach.\n", PID=getpid(), hostname);
    fflush(stdout);
    while (i>0) {
      printf("PID %d on %s will wait  for `gdb` to attach for %d more iterations.\n", PID, hostname, i);
      fflush(stdout);
      sleep(5);
      i--;
    }
  }
#endif

然后我重新编译（没有 -DDEBUG=1 选项，所以上面的代码被排除在外）

$ mpicc -Wall -I<directories...> -c myprogram.c
$ mpicc -o myprogram myprogram.o -Wall <some other options...>

程序编译没有问题。然后我像这样执行它：

$ mpirun -np 3 myprogram

有时（而且越来越频繁），可执行文件的不同副本在集群的不同节点上运行？在某些节点上，调试代码会执行（并打印），而在某些节点上则不会。

请注意，集群当前正在经历一些“时钟偏差”（或类似的东西），这可能是原因。那是问题吗？

另请注意，我实际上只是通过在 Makefile 中注释/取消注释行来更改编译选项，因为我还没有时间实施这些建议。

编辑：当问题发生时，在问题出现md5sum myprogram的节点上返回不同的值。

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您的不同节点保留了文件的副本，并且在您运行二进制文件时使用该文件而不是最新的。这与 Gentoo 几乎没有关系，因为它是 Linux（内核）缓存和/或 NFS 实现的产物。

换句话说，你的二进制文件被缓存了。阅读这个答案：

NFS 缓存清理命令？

调整一些设置也可能有所帮助。

我碰巧在这里有一个同步和刷新的命令：

$ cat /home/jaroslav/bin/flush_cache 
sudo sync
sudo sh -c 'echo 3 > /proc/sys/vm/drop_caches'
于 2014-03-10T05:45:01.237 回答