2

我有一些 netCDF 文件,每个方向 ( x, y, z) 有 24 个,24 个具有不同时间的值。在最后一点,我必须绘制所有时间步的数据。

对于绘图,我需要在特定点进行插值,所以我必须知道最近的邻居。我的计划是将数据分成 3D 单元格,这样我就不必在整个数据集中搜索最近的邻居。

所以在我的第一步中,我读入了我的数据文件并创建了一个包含[x,y,z,v[:]]每个点的坐标和每次值的数组。

之后,我为每个点计算它所属的单元格,并将其附加到 4 维数组:xy和:zv

for vec in vecs:
    x_ind = int((vec[0]-xmin) / stepWidthX) 
    y_ind = int((vec[1]-ymin) / stepWidthY) 
    z_ind = int((vec[2]-zmin) / stepWidthZ) 

    if x_ind==gridPointsInXdirection:
        x_ind = x_ind-1
    if y_ind==gridPointsInYdirection:
        y_ind = y_ind-1
    if z_ind==gridPointsInZdirection:
        z_ind = z_ind-1
    #print z_ind, y_ind,x_ind

    XGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind] = np.append(XGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind], vec[0])
    YGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind] = np.append(YGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind], vec[1])
    ZGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind] = np.append(ZGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind], vec[2])
    VGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind] = np.append(VGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind], vec[3])

vecs包含所有数据点的数组在哪里。到目前为止它正在工作,但我现在的问题在于VGridPoints:我有一长串值而不是数组列表。是否有将数组附加到数组元素的解决方案,以便我以后可以访问它,例如:

x = XGridPoints[2,3,4][2]
y = YGridPoints[2,3,4][2]
z = ZGridPoints[2,3,4][2]
v[:] = VGridPoints[2,3,4][2]

当我只采取一个时间步时,它正在工作,但是如果我为每个时间步重新计算单元格和最近的邻居并且它们不会随着时间的推移改变位置,我会有很大的过载。

4

1 回答 1

2

如果您先验地知道要使用的数组的形状,Numpy 通常会更方便。像附加到数组这样的事情会受到性能损失。我同意塞巴斯蒂安的观点,最简单的方法(如果可能的话)是创建一个足够大的数组来容纳所有东西(最坏的情况)。如果这是不可能的,那么也许您可以尝试使用对象数组。例如,创建一个具有 3 个空间维度的对象数组:

import numpy as N
XGridPoints = N.empty((nx, ny, nz), dtype='object')

(对于YGridPoints, ZGridPoints,也是VGridPoints如此。)然后您可以设置XGridPoints[z_ind, y_ind, x_ind]为一个 numpy 数组并根据需要附加到该数组。

于 2012-08-27T17:17:53.030 回答