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我正在尝试在 R 中做一些密度图。我最初使用密度图,但我更改为 ggplot2 中的密度图,因为我在视觉上更喜欢 ggplot2。

所以我使用密度图函数做了一个密度图,并在 ggplot2 中做了一个密度图(见下文),但我发现这些图并不相同。看起来 ggplot2(右图)中的一些 y 值已丢失或丢失。这有什么特别的原因吗?如何使 ggplot 与命运图(左图)相同。

在此处输入图像描述

代码:

library(ggplot2)
library(grid)
par(mfrow=c(1,2))

# define function to create multi-plot setup (nrow, ncol)
vp.setup <- function(x,y){
 grid.newpage()
 pushViewport(viewport(layout = grid.layout(x,y)))
}

# define function to easily access layout (row, col)
vp.layout <- function(x,y){
  viewport(layout.pos.row=x, layout.pos.col=y)
}


vp.setup(1,2)

dat <- read.table(textConnection("
low high
10611.0 14195.0
10759.0 14437.0
10807.0 14574.0
10714.0 14380.0
10768.0 14448.0
10601.0 14239.0
10579.0 14218.0
10806.0 14510.0
"), header=TRUE, sep="\t")

plot(density(dat$low))

dat.low = data.frame(low2 = c(dat$low), lines = rep(c("low")))

low_plot_gg = (ggplot(dat.low, aes(x = low2, fill = lines)) +
 stat_density(aes(y = ..density..)) + 
 coord_cartesian(xlim = c(10300, 11000)) 
)
print(low_plot_gg, vp=vp.layout(1,2))
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基于一些试验和错误,它看起来像你想要的

 + xlim(c(10300,11000))

而不是

 + coord_cartesian(xlim = c(10300, 11000)) 

coord_cartesian扩展了绘图的范围,但根本不改变绘图内部的内容......

于 2012-08-24T15:09:50.610 回答
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这不是失去价值的问题。该函数plot(density())继续对极值进行平滑处理,但对于您的小数据集来说它不是很准确。对于更大的数据集,这两个图将是相同的。

于 2012-08-24T15:13:14.320 回答