orterun
(Open MPI SPMD/MPMD 启动器;mpirun/mpiexec
只是它的符号链接)对进程绑定有一些支持,但它不够灵活,无法让您在每个核心绑定两个进程。您可以尝试使用-bycore -bind-to-core
,但当所有核心都已分配一个进程时,它会出错。
但是有一种解决方法 - 您可以使用rankfile来明确指定将每个 rank 绑定到哪个插槽。下面是一个示例:为了在双核 CPU 上运行 4 个进程,每个内核有 2 个进程,您可以执行以下操作:
mpiexec -np 4 -H localhost -rf rankfile ./application
其中rankfile
是具有以下内容的文本文件:
rank 0=localhost slot=0:0
rank 1=localhost slot=0:0
rank 2=localhost slot=0:1
rank 3=localhost slot=0:1
这会将等级 0 和 1 放在处理器 0 的核心 0 上,并将等级 2 和 3 放在处理器 0 的核心 1 上。丑陋但有效:
$ mpiexec -np 4 -H localhost -rf rankfile -tag-output cat /proc/self/status | grep Cpus_allowed_list
[1,0]<stdout>:Cpus_allowed_list: 0
[1,1]<stdout>:Cpus_allowed_list: 0
[1,2]<stdout>:Cpus_allowed_list: 1
[1,3]<stdout>:Cpus_allowed_list: 1
编辑:从您的另一个问题可以清楚地看出您实际上是在超线程 CPU 上运行。然后,您必须弄清楚逻辑处理器的物理编号(这有点令人困惑,但物理编号对应于 中processor:
报告的值/proc/cpuinfo
)。获取它的最简单方法是安装hwloc
库。它提供了hwloc-ls
您可以像这样使用的工具:
$ hwloc-ls --of console
...
NUMANode L#0 (P#0 48GB) + Socket L#0 + L3 L#0 (12MB)
L2 L#0 (256KB) + L1 L#0 (32KB) + Core L#0
PU L#0 (P#0) <-- Physical ID 0
PU L#1 (P#12) <-- Physical ID 12
...
物理 ID 列P#
在括号中。在您的 8 核情况下,第一个核心(核心 0)的第二个超线程很可能具有 ID 8
,因此您的 rankfile 看起来像:
rank 0=localhost slot=p0
rank 1=localhost slot=p8
rank 2=localhost slot=p1
rank 3=localhost slot=p9
(注意p
前缀 - 不要省略它)
如果您没有hwloc
或无法安装它,那么您将不得不自己解析/proc/cpuinfo
。超线程将具有相同的 和 值,physical id
但core id
不同的processor
和apicid
。物理 ID 等于 的值processor
。