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我正在建立一个 Cox PH 统计模型来预测乳腺癌患者的复发概率。我想为患者或医生创建一个在线界面，让他们可以输入相关的患者特征，并计算复发的概率。这是一个完美的例子，尽管是针对前列腺癌： http: //nomograms.mskcc.org/Prostate/PostRadicalProstatectomy.aspx

我的基本计划是使用 python 创建工具，并根据用户的输入和我之前安装的 Cox PH 模型使用 R 计算概率。该工具需要下拉框和用户输入的数值。问题是我从来没有用 Python 做过任何网络编程或 GUI 编程。我的经验是 Python 的科学编程方面（例如 Pylab 等）。我的问题是：

  1. 我需要哪些与 Python 和 R 相关的软件包？从我所做的一些谷歌搜索来看，RPy 和 Tkinter 似乎是明确的选择。
  2. 我如何存储统计模型，这样工具就不必在每次有人使用它时都从我的数据集中计算模型？对于 Cox PH 模型，这将需要存储基线危害和模型公式。
  3. 您的经验中有什么有用的提示吗？

我真的很感谢你的帮助！

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除了使用Rthrough或等效程序之外， statsmodels（以前的）python 库RPy中还有许多生存分析例程。不过，它们在“沙盒”包中，这意味着它们现在不应该准备好投入生产。sicpy.statsmodel

例如，您在此处编码了比例风险的 Cox 模型。

另请参阅CrossValidated 上的这个问题。

于 2013-06-25T16:00:20.193 回答
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基本上你需要学习 WebDev，这是一个相当庞大的话题。如果你真的想把它变成一个 web 应用程序，那么 Django 是最容易开始的地方之一，而且它的文档也很精彩。所以基本上我的答案是：

http://djangobook.com/en/2.0/

开始阅读。

于 2012-07-11T22:07:57.593 回答
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我建议在 R 中安装您的模型并轻松使用“DynNom”包（“DNbuilder”功能）。它将为您的预测模型创建这样一个交互式工具，您可以轻松地将其作为网页共享，而无需任何 Web 编程或 GUI 编程技能。这将是拟合模型后的一行代码，例如：

fit1 <- coxph(Surv(time, status) ~ age + sex + ph.ecog, data = lung) 
library(DynNom)
DNbuilder(fit1)

您可以轻松地在http://shinyapps.io/的帐户上共享它，或将其托管在您的网站上（需要更多努力）。

于 2020-07-13T15:14:36.940 回答