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我们想将数组零中的所有值设置为负数。

我尝试了很多东西,但还没有找到可行的解决方案。我考虑了一个带有条件的 for 循环,但这似乎不起作用。

#pred_precipitation is our array
pred_precipitation <-rnorm(25,2,4)     

for (i in nrow(pred_precipitation))
{
  if (pred_precipitation[i]<0) {pred_precipitation[i] = 0}
  else{pred_precipitation[i] = pred_precipitation[i]}
}
4

4 回答 4

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感谢您提供可重现的示例。这是非常基本的 R 东西。您可以分配给向量的选定元素(注意数组具有维度,并且您给出的是向量而不是数组):

> pred_precipitation[pred_precipitation<0] <- 0
> pred_precipitation
 [1] 1.2091281 0.0000000 7.7665555 0.0000000 0.0000000 0.0000000 0.5151504 0.0000000 1.8281251
[10] 0.5098688 2.8370263 0.4895606 1.5152191 4.1740177 7.1527742 2.8992215 4.5322934 6.7180530
[19] 0.0000000 1.1914052 3.6152333 0.0000000 0.3778717 0.0000000 1.4940469

基准战!

@James 找到了一种更快的方法并将其留在评论中。我支持他,只是因为我知道他的胜利将是短暂的。

首先,我尝试编译,但这似乎对任何人都没有帮助:

p <- rnorm(10000)
gsk3 <- function(x) { x[x<0] <- 0; x }
jmsigner <- function(x) ifelse(x<0, 0, x)
joshua <- function(x) pmin(x,0)
james <- function(x) (abs(x)+x)/2
library(compiler)
gsk3.c <- cmpfun(gsk3)
jmsigner.c <- cmpfun(jmsigner)
joshua.c <- cmpfun(joshua)
james.c <- cmpfun(james)

microbenchmark(joshua(p),joshua.c(p),gsk3(p),gsk3.c(p),jmsigner(p),james(p),jmsigner.c(p),james.c(p))
           expr      min        lq    median        uq      max
1     gsk3.c(p)  251.782  255.0515  266.8685  269.5205  457.998
2       gsk3(p)  256.262  261.6105  270.7340  281.3560 2940.486
3    james.c(p)   38.418   41.3770   43.3020   45.6160  132.342
4      james(p)   38.934   42.1965   43.5700   47.2085 4524.303
5 jmsigner.c(p) 2047.739 2145.9915 2198.6170 2291.8475 4879.418
6   jmsigner(p) 2047.502 2169.9555 2258.6225 2405.0730 5064.334
7   joshua.c(p)  237.008  244.3570  251.7375  265.2545  376.684
8     joshua(p)  237.545  244.8635  255.1690  271.9910  430.566

编译比较

可是等等!Dirk 写了这个 Rcpp 东西。一个完全没有 C++ 能力的人可以阅读他的 JSS 论文,修改他的示例,并编写所有这些中最快的函数吗?敬请关注,亲爱的听众。

library(inline)
cpp_if_src <- '
  Rcpp::NumericVector xa(a);
  int n_xa = xa.size();
  for(int i=0; i < n_xa; i++) {
    if(xa[i]<0) xa[i] = 0;
  }
  return xa;
'
cpp_if <- cxxfunction(signature(a="numeric"), cpp_if_src, plugin="Rcpp")
microbenchmark(joshua(p),joshua.c(p),gsk3(p),gsk3.c(p),jmsigner(p),james(p),jmsigner.c(p),james.c(p), cpp_if(p))
         expr      min        lq    median        uq       max
1   cpp_if(p)    8.233   10.4865   11.6000   12.4090    69.512
2     gsk3(p)  170.572  172.7975  175.0515  182.4035  2515.870
3    james(p)   37.074   39.6955   40.5720   42.1965  2396.758
4 jmsigner(p) 1110.313 1118.9445 1133.4725 1164.2305 65942.680
5   joshua(p)  237.135  240.1655  243.3990  250.3660  2597.429

与rcpp比较

这是肯定的,船长。

p即使您没有分配给它,这也会修改输入。如果你想避免这种行为,你必须克隆:

cpp_ifclone_src <- '
  Rcpp::NumericVector xa(Rcpp::clone(a));
  int n_xa = xa.size();
  for(int i=0; i < n_xa; i++) {
    if(xa[i]<0) xa[i] = 0;
  }
  return xa;
'
cpp_ifclone <- cxxfunction(signature(a="numeric"), cpp_ifclone_src, plugin="Rcpp")

不幸的是,这扼杀了速度优势。

于 2012-06-30T15:15:58.360 回答
19

我会使用pmax,因为ifelse有时可能会有点慢,并且子集替换会创建一个额外的向量(这可能是大型数据集的问题)。

set.seed(21)
pred_precipitation <- rnorm(25,2,4)
p <- pmax(pred_precipitation,0)

到目前为止,子集替换是最快的:

library(rbenchmark)
gsk3 <- function(x) { x[x<0] <- 0; x }
jmsigner <- function(x) ifelse(x<0, 0, x)
joshua <- function(x) pmin(x,0)
benchmark(joshua(p), gsk3(p), jmsigner(p), replications=10000, order="relative")
         test replications elapsed relative user.self sys.self
2     gsk3(p)        10000   0.215 1.000000     0.216    0.000
1   joshua(p)        10000   0.444 2.065116     0.416    0.016
3 jmsigner(p)        10000   0.656 3.051163     0.652    0.000

自动绘图微基准

于 2012-06-30T15:25:33.200 回答
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或者,您也可以使用ifelse

ifelse(pred_precipitation < 0, 0, pred_precipitation)
于 2012-06-30T15:21:59.787 回答
4

如果您的主要对象是 tibble 或数据框,您也可以使用 tidy 包。与 Ari B. Friedman 提出的替换相比,替换可以“即时”编写并与其他突变结合使用。

使用 dplyr 和管道的示例%>%如下所示:

df %>% mutate(varA = if_else(varA < 0, 0, varA))

mutate()您可以在语句中添加更多突变(即新变量) 。我在这种类型的编码中看到的一个优点是您不会冒跳过或重新执行单个转换步骤的风险,因为它们都分组在一个语句中。例如,通过%>% View()在 RStudio 中添加,您已经可以预览结果。但是,结果尚未存储在任何地方(“即时”)。这样,您在更改代码时可以保持命名空间/环境的清洁。

于 2020-02-12T14:24:52.120 回答