python - python matplotlib - 等高线图 - 置信区间

Question

我正在尝试使用 matplotlib.pyplot.contour 在数据网格上绘制轮廓（可行），但轮廓放置在距离峰值 1、2 和 3 sigma 处。除了蛮力之外，有没有一种巧妙的方法可以做到这一点？谢谢！

Python版本是

Python 2.7.2 |EPD 7.2-2（64 位）| （默认，2011 年 9 月 7 日，16:31:15）[GCC 4.0.1 (Apple Inc. build 5493)] 在 darwin

Answer 1

您可以指定z-values绘制轮廓的位置列表。所以你所要做的就是z-values为你的分发收集正确的。以下是“距离峰值 1、2 和 3 sigma”的示例：

代码：

import numpy as np
import matplotlib.cm as cm
import matplotlib.mlab as mlab
import matplotlib.pyplot as plt

#Set up the 2D Gaussian:
delta = 0.025
x = np.arange(-3.0, 3.0, delta)
y = np.arange(-3.0, 3.0, delta)
X, Y = np.meshgrid(x, y)
sigma = 1.0
Z = mlab.bivariate_normal(X, Y, sigma, sigma, 0.0, 0.0)
#Get Z values for contours 1, 2, and 3 sigma away from peak:
z1 = mlab.bivariate_normal(0, 1 * sigma, sigma, sigma, 0.0, 0.0)
z2 = mlab.bivariate_normal(0, 2 * sigma, sigma, sigma, 0.0, 0.0)
z3 = mlab.bivariate_normal(0, 3 * sigma, sigma, sigma, 0.0, 0.0)

plt.figure()
#plot Gaussian:
im = plt.imshow(Z, interpolation='bilinear', origin='lower',
                 extent=(-50,50,-50,50),cmap=cm.gray)
#Plot contours at whatever z values we want:
CS = plt.contour(Z, [z1, z2, z3], origin='lower', extent=(-50,50,-50,50),colors='red')
plt.savefig('fig.png')
plt.show()