我已经在我的 Linux 机器上安装了 BLAST+ 以及微生物数据库的本地副本。“blastn”适用于类似的查询
blastn -query query.txt -db 16SMicrobial
但是,blastp 失败,例如
blastp -query query_protein.txt -db 16SMicrobial
给
BLAST 数据库错误:在搜索路径 [..../databases] 中找不到蛋白质数据库 [16SMicrobial] 的别名或索引文件
我的数据库目录有这些文件-
16SMicrobial.nhr 16SMicrobial.nnd 16SMicrobial.nog 16SMicrobial.nsi 16SMicrobial.nin 16SMicrobial.nni 16SMicrobial.nsd 16SMicrobial.nsq
我的.ncbirc
文件有
[NCBI]
DATA=.../databases
[BLAST]
BLASTDB=.../databases
请问有什么问题吗?