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我正在尝试在我的笔记本电脑(MacBook Pro 10.5.8,MPICH2-1.1)上安装 PETSc-3.2,并且在运行测试时遇到了一些困难:它从getdomainname()返回错误地址的系统调用中出错。

[-1]PETSC ERROR: --------------------- Error Message ------------------
[-1]PETSC ERROR: Error in system call!
[-1]PETSC ERROR: getdomainname()!
[-1]PETSC ERROR: ------------------------------------------------------

为了进行调查,我编写了以下测试代码来检查getdomainname()使用和不使用 MPI 的功能:

单处理器:

#include <unistd.h>
#include <stdio.h>
#include <errno.h>
#include <string.h>
#include <limits.h>
#include <stdlib.h>

int main(int argc, char **argv)
{
  char *name;
  int namelen = CHAR_MAX;
  name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
  int err = getdomainname(name,namelen);
  printf("%s\n",strerror(errno));
  printf("Domain name: %s\n",name);
  return err;
} 

平行线:

/* Headers */
#include "mpi.h"

int main(int argc, char **argv)
{
  MPI_Init(&argc,&argv);

  int myrank;
  char *mpi_name;
  int mpi_namelen = MPI_MAX_PROCESSOR_NAME;
  mpi_name = (char*) calloc (mpi_namelen,sizeof(char));

  MPI_Comm_rank(MPI_COMM_WORLD,&myrank);
  int mpi_err = MPI_Get_processor_name(mpi_name,&mpi_namelen);
  printf("MPI_Get_processor_name [%d]: %s\n",mpi_err,mpi_name);

  char *name;
  int namelen = CHAR_MAX;
  name = (char*) calloc (namelen,sizeof(char));
  int err = getdomainname(name,namelen);
  printf("%s\n",strerror(errno));
  printf("Domain name: %s\n",name);
  return err;

  MPI_Finalize();
}

单处理器代码正常工作,并行代码获取处理器的正确名称,但在调用时返回错误地址,getdomainname()即使使用mpirun -np 1.

有没有人遇到过这样的问题?是否需要进行某种配置,mpirun以便为 MPI 生成的每个进程设置域名?提前致谢!

更新:

对于那些使用 PETSc 遇到此问题的人,请使用选项--with-debugging=0. 似乎在一些 PETSc 调试消息等中,他们使用调用getdomainname()而不是MPI_Get_processor_name(). 在不调试的情况下编译会禁用库中的这个分支。

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尝试更新版本的 MPICH2,1.1 很旧。除非您要求,否则当前版本不应添加任何-m32/-m64参数。mpicc(我也不确定旧版本是否这样做,但这是可能的)

于 2012-06-01T13:29:27.620 回答