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loadtxt在 python 中使用 numpy 的函数来将数据从文本文件加载到数组中。不应该引起任何问题的标准东西。

我在 ubuntu 10.04 下编写了一个脚本来执行此操作,并且它完美地工作。但是我最近升级到 ubuntu 12.04(完全重新安装,而不是升级),现在脚本不起作用。

这是文件中的一行,所有行都具有相同的结构:11 列由制表符分隔:

Av = 0° Bv = 78°    273013  247744  1327      ****  Av' = 156°  Bv = 78°    259197  247803  1551

我想要第5列和第11列的数据,所以我用这个命令来加载数据:loadtxt(file, usecols=(4,10),delimiter='\t')

但它不起作用,这里 ipython 吐出什么:

In [46]: test=loadtxt(file,usecols=(4,10),delimiter='\t')
--------------------------------------------------------------------------- ValueError   
Traceback (most recent call last)  <ipython-input-46-20a0923eaf9b> in <module>()
----> 1 test=loadtxt(file,usecols=(4,10),delimiter='\t')

/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/npyio.pyc in loadtxt(fname, dtype, comments, delimiter, converters, skiprows, usecols, unpack, ndmin)
    794                 vals = [vals[i] for i in usecols]
    795             # Convert each value according to its column and store

--> 796             items = [conv(val) for (conv, val) in zip(converters, vals)]
    797             # Then pack it according to the dtype's nesting

    798             items = pack_items(items, packing)

ValueError: could not convert string to float:

它曾经与我的旧系统(ubuntu 10.04)一起工作,但我无法在我的新安装(ubuntu 12.04)下从这个文件加载数据。

如果有人能指出我出了什么问题,将不胜感激!

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我不知道为什么loadtxt以前可以工作,它目前不能很好地处理字符串。但是您可以使用genfromtxt来处理此记录:

import numpy as np

out = np.genfromtxt(file, usecols=(4,10), delimiter='\t')

如果省略usecols并加载整个记录,则它将字符串条目替换为nans。

于 2012-06-01T12:32:35.023 回答