我有一个克隆的回购。有一个目录，称它为 a/b/c，它曾经是它自己的 repo，即有 a/b/c/.git/ 等。
现在我想要在主仓库中管理的文件。我不关心 a/b/c 中的历史，所以我删除了 a/b/c 中的 .git 目录
但问题是git status完全忽略了 a/b/c。我做不到git add。就好像我将路径放入 .gitignore （我没有）。
显然，在此之前，git 忽略其中包含 .git 目录的子目录是有意义的，但现在它如何知道其中的区别？
除了 .gitignore 和 .git/info/excludes 之外，是否还有其他地方列出了忽略文件？.git/config 文件中什么都没有？
有人问我 git status 说什么。不多：
/path/to/root/dir $ git status
# On branch fred
nothing to commit (working directory clean)
以及 git add 所说的。更少（无）
/path/to/root/dir $ git add a/b/c
我不知道问题是什么或它是如何出现的（v。烦人），但这是我修复它的方法，以防其他人被卡住：
git rm --cached a/b/c
git commit -m "removed phantom a/b/c dir"
git add a/b/c
git commit -m "finally able to add a/b/c"
有趣的是git log a/b/c只列出了“终于能够...”提交。git show HEAD^（“删除的幻影......”提交说
-Subproject commit c311ccdc91c8be66019aa138d1c4af49a6b7a81c
所以它看起来像是在特别对待它。我将不得不阅读更多关于子项目和/或子模块的内容。
你有一个全局 gitignore 文件吗？（检查git config core.excludesfile）
用于git add -f强制 git 添加它当前忽略的文件。
摘要：您的 .gitignore 文件（包括目录本身中的任何文件）是否忽略了目录包含的所有内容。如果是这样，Git 会将其视为空而不列出）
我有一个类似的问题。我发现被忽略的目录包含一个 .gitignore 文件（虽然不是 .git 目录）。删除它后，git 突然再次对它感兴趣，并将其列为git status.
当我通过将 .gitignore 的原始内容从较早的终端中粘贴回来来恢复它们时，git 再次没有看到或将目录列为未跟踪。
通过反复试验，我发现我可以从 .gitignore 中删除所有内容，但以下条目除外：
.factorypath
.springBeans
如果这两行都在 .gitignore 文件中，那么 git 看不到包含目录（它不是 git 存储库的根目录）。
这提出的问题比它对我的回答要多。
这是目录列表，但我看不到模式。
total 72
drwxr-xr-x@ 10 stephen staff 320 30 Aug 19:04 .
drwxr-xr-x 17 stephen staff 544 30 Aug 18:59 ..
drwxr-xr-x 2 stephen staff 64 25 Jun 15:00 .apt_generated
-rw-r--r-- 1 stephen staff 1341 25 Jun 15:00 .classpath
-rw-r--r-- 1 stephen staff 18665 28 Jun 10:44 .factorypath
-rw-r--r--@ 1 stephen staff 25 30 Aug 19:12 .gitignore
-rw-r--r-- 1 stephen staff 1094 28 Jun 10:44 .project
drwxr-xr-x 7 stephen staff 224 25 Jun 15:00 .settings
-rw-r--r-- 1 stephen staff 479 28 Jun 15:43 .springBeans
drwxr-xr-x 6 stephen staff 192 2 Jul 12:41 target
看来空目录对于Git来说基本上是不存在的。如果目录中的所有文件都匹配 .gitignore 模式，那么 git 会将目录视为空。
我在带有 foo.tgz 文件的目录上发生了这种情况，并且在 repo 的根目录下，.gitignore 文件具有模式 *.tgz。非常令人沮丧的是，“git check-ignore”命令没有报告“嘿，菜鸟，我的目录看起来是空的”之类的东西。
下次试试这个：
git check-ignore strangely-ignored-directory/*
该输出可能会解开谜团。
刚才我出现了这个问题，因为我曾经在一个由 git 控制的顶级文件夹create-react-app中初始化一个应用程序：clienttodo
cd todo
npx create-react-app client --template typescript
在引擎盖下，这创建了client一个包含.git目录和文件的.gitignore文件夹。这就像一个 git 子项目。
当我通过git add -i源代码控制添加项目时，创建了一个奇怪的空目录指针，但没有内容。
我使用了命令
git rm --cached client
...它删除了 git 存储的奇怪的空目录/指针。但是当我尝试添加文件夹时，我收到了这条消息：
~/depot/todo $ git add client
warning: adding embedded git repository: client
hint: You've added another git repository inside your current repository.
hint: Clones of the outer repository will not contain the contents of
hint: the embedded repository and will not know how to obtain it.
hint: If you meant to add a submodule, use:
hint:
hint: git submodule add <url> client
hint:
hint: If you added this path by mistake, you can remove it from the
hint: index with:
hint:
hint: git rm --cached client
hint:
hint: See "git help submodule" for more information.
为了解决这个问题，我删除了 git 工件，然后我可以正常提交。
rm -Rf client/.git
rm -f client/.gitignore
git add client
git commit -m "Add missing client content"