r - ggplot2 - 抖动和位置闪避一起

Question

我正在尝试从 GGplot2 研讨会http://dl.dropbox.com/u/42707925/ggplot2/ggplot2slides.pdf重新创建一个数字。

在这种情况下，我试图生成示例 5，其中抖动的数据点会受到闪避。当我运行代码时，这些点以正确的线为中心，但没有抖动。

这是直接来自演示文稿的代码。

set.seed(12345)
hillest<-c(rep(1.1,100*4*3)+rnorm(100*4*3,sd=0.2),
       rep(1.9,100*4*3)+rnorm(100*4*3,sd=0.2))
rep<-rep(1:100,4*3*2)
process<-rep(rep(c("Process 1","Process 2","Process 3","Process 4"),each=100),3*2)
memorypar<-rep(rep(c("0.1","0.2","0.3"),each=4*100),2)
tailindex<-rep(c("1.1","1.9"),each=3*4*100)
ex5<-data.frame(hillest=hillest,rep=rep,process=process,memorypar=memorypar, tailindex=tailindex)
stat_sum_df <- function(fun, geom="crossbar", ...) {stat_summary(fun.data=fun, geom=geom, ...) }

dodge <- position_dodge(width=0.9) 
p<- ggplot(ex5,aes(x=tailindex ,y=hillest,color=memorypar)) 
p<- p + facet_wrap(~process,nrow=2) + geom_jitter(position=dodge) +geom_boxplot(position=dodge)  
p

Answer 1

在ggplot2版本1.0.0中，有一个新的职位被命名position_jitterdodge()为这种情况。这个位置应该在里面使用，geom_point()并且应该在fill=里面使用aes()来显示通过哪个变量来躲避你的数据。为了控制躲避参数的宽度，dodge.width=应该使用。

ggplot(ex5, aes(x=tailindex, y=hillest, color=memorypar, fill=memorypar)) +
      facet_wrap(~process, nrow=2) +
      geom_point(position=position_jitterdodge(dodge.width=0.9)) +
      geom_boxplot(fill="white", outlier.colour=NA, position=position_dodge(width=0.9))

Answer 2

编辑ggplot2：版本 1.0.0有一个更好的解决方案，使用position_jitterdodge. 请参阅@Didzis Elferts 的回答。注意dodge.width控制闪避的宽度和jitter.width控制抖动的宽度。

我不确定代码如何在 pdf 中生成图表。

但是这样的事情会让你接近你所追求的吗？

我将tailindexand转换memorypar为数字；将它们加在一起；结果是geom_jitter图层的 x 坐标。可能有一种更有效的方法来做到这一点。另外，我想看看如何躲避geom_boxplot和geom_jitter并且没有抖动，将如何在 pdf 中生成图形。

library(ggplot2)
dodge <- position_dodge(width = 0.9)
ex5$memorypar2 <- as.numeric(ex5$tailindex) + 
  3 * (as.numeric(as.character(ex5$memorypar)) - 0.2) 

p <- ggplot(ex5,aes(x=tailindex , y=hillest)) +
   scale_x_discrete() +
   geom_jitter(aes(colour = memorypar, x = memorypar2), 
     position = position_jitter(width = .05), alpha = 0.5) +
   geom_boxplot(aes(colour = memorypar), outlier.colour = NA, position = dodge) +
   facet_wrap(~ process, nrow = 2)
p