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我的文件是：

CT.BP.50.txt
CT.BP.200.txt
CT.BP.500.txt 
GP.BP.50.txt
GP.BP.200.txt 
GP.BP.500.txt 

files <- c("CT.BP.50.txt", "CT.BP.200.txt", "CT.BP.500.txt", "GP.BP.50.txt", "GP.BP.200.txt", "GP.BP.500.txt")

我想对它们执行特定的操作，我可以这样做：

for (i in 1:length(files)) {
    foo <- read.table(files[i])
    barplot(table(foo$V1), main = files[i])
}

但是 R 按以下顺序绘制它们：

“CT.BP.200.txt” “CT.BP.500.txt” “CT.BP.50.txt” “GP.BP.200.txt” “GP.BP.500.txt” “GP.BP. 50.txt"

我希望它们按排序顺序绘制：

“CT.BP.50.txt” “CT.BP.200.txt” “CT.BP.500.txt” “GP.BP.50.txt” “GP.BP.200.txt” “GP.BP. 500.txt"

如何对具有字母数字名称的对象进行排序？

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3 回答 3

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问题是它list.files()以标准（词法）排序顺序返回文件名，并且数字是逐位比较的，而不是作为数字的一部分。

files <- sort(c("Gen.Var_CT.BP.200.txt", "Gen.Var_CT.BP.500.txt", 
                "Gen.Var_CT.BP.50.txt", "Gen.Var_GP.BP.200.txt",
                "Gen.Var_GP.BP.500.txt", "Gen.Var_GP.BP.50.txt"))

在我的系统上，这给出了：

> files
[1] "Gen.Var_CT.BP.200.txt" "Gen.Var_CT.BP.50.txt"  "Gen.Var_CT.BP.500.txt"
[4] "Gen.Var_GP.BP.200.txt" "Gen.Var_GP.BP.50.txt"  "Gen.Var_GP.BP.500.txt"

该函数gtools::mixedsort将（通常）按您想要的方式排序：字符串中的一系列数字将被视为数字以进行排序。但是，您的示例存在一些问题，因为mixedsort假设.是数字的一部分，因此被.200.视为潜在数字，实际上不能将其排序为数字。由于您的示例中没有实际的小数点，因此您可以解决这个问题。

files <- files[mixedorder(gsub("\\.", " ", files))]

所以文件现在排序为：

> files
[1] "Gen.Var_CT.BP.50.txt"  "Gen.Var_CT.BP.200.txt" "Gen.Var_CT.BP.500.txt"
[4] "Gen.Var_GP.BP.50.txt"  "Gen.Var_GP.BP.200.txt" "Gen.Var_GP.BP.500.txt"
于 2012-04-13T16:29:10.487 回答
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这能行吗？

files <- c("Gen.Var_CT.BP.50.txt", "Gen.Var_CT.BP.200.txt", "Gen.Var_CT.BP.500.txt",    "Gen.Var_GP.BP.50.txt", "Gen.Var_GP.BP.200.txt", "Gen.Var_GP.BP.500.txt"){
for (i in 1:length(files)) {
  b <- read.table(files[i])
  barplot(table(b$V1), main=files[i])
于 2012-04-13T16:07:46.693 回答
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看起来您想按特定顺序按文件名的特定组成部分进行排序。

因此，我首先将文件名分解为其组件，例如：

filesmat=matrix(unlist(strsplit(files,split='\\.')),byrow=T,ncol=4)

然后提取要排序的列。

numbercomponent=as.numeric(filesmat[,3])

varname=filesmat[,1]

然后用类似的东西重新排序文件名

files=files[order(varname,numbercomponent)]

然后随心所欲地绘制。

于 2012-04-13T16:24:32.023 回答