问题标签 [xmltodict]

我有一个脚本，它需要一堆 XML 文件，所有格式都是：HMDB61152.xml并将它们全部拉入 using glob. 对于每个文件，我需要提取每个文件的一些详细信息，例如accession、name和diseases. 解析我使用的每个 XML，xmltodict因为我传统上喜欢使用列表而不是 XML 文件，尽管由于我面临的问题，我可能需要改变我的策略。

我能够轻松地提取name，acc因为所有 XML 文件都将它放在树的同一第一级：

path = '/Users/me/Downloads/hmdb_metabolites' for data_file in glob.glob(os.path.join(path,'*.xml')): diseases=[] with open(data_file) as fd: doc = xmltodict.parse(fd.read()) name = doc['metabolite']['name'] acc = doc['metabolite']['accession']

所以基本上在这一点上，疾病信息有三个选项：

1. 每棵树中有多个disease标签。diseases即，给定的种质有两种或多种疾病。
2. disease树中有一个diseases意味着该种质只有一种疾病。或者
3. 树上根本没有disease。diseases

我需要编写一个可以处理任何三种情况的循环，这就是我失败的地方。到目前为止，这是我的方法：

所以问题是，对于有多种疾病的情况，我需要按以下格式提取它们的名称：doc['metabolite']['diseases']['disease'][x]['name']对于疾病中的每个x。但是对于那些只有一种疾病的，他们根本没有索引，所以我能提取出那种疾病的名字的唯一方法就是做doc['metabolite']['diseases']['disease']['name']。

该脚本失败是因为一旦我们遇到只有一种疾病的案例，它就会在尝试测试 if 时返回 KeyError doc['metabolite']['diseases']['disease'][0]) == True。如果有人可以帮助我解决这个问题，那就太好了，或者指导我采取更合适的策略。

我正在尝试将 xmltodict 包添加到 Linux 上的 Python。

我在我的 Linux 版本上安装了 2 个 Python；Python 2.7（默认）和 Python 3.5（以 Anaconda 安装的形式）。我想将 xmltodict 添加到 Python 3 安装中，但是当我使用sudo apt-get install python-xmltodict它时，会将其添加到默认的 Python 2.7 安装中。

如何在不更改默认值或使用 pip 的情况下将此包添加到我的 Python 3 安装中？我也不想用虚拟环境重建我的安装

我有一个这样的xml文件：

是否有可能使用 xmltodict 在不知道具体索引的情况下找到属性“SecondProp”并将值从“二”更改为“十七”？（以下）

代码：

输出：

访问 xmltodict 转换后的值。我有一个看起来像这样的 xml

我正在尝试访问 CASE 字典。如果我删除第二个 XML 行并尝试返回 d[PQ]['CASE']，我会得到想要的结果这是代码：

d 的输出如下所示：

Python - 2.7.3 我想比较两个 xml 文件（大小约为 - 100 MB） 我根据此线程的讨论更新了代码。 比较python中的两个xml文件

我使用 element.iter() 而不是 GetChildren()。出于测试目的，我编辑了 xml 文件并使其非常短，即 1MB 大小。

以下是代码。

我这样称呼它

但它给了我以下错误

我究竟做错了什么？Zip 功能是否非常繁重，难以循环？有没有替代方案。在进行 XML 比较时，我想比较 a)Text B)tag

我有一个来自 xmltodict 的基本示例，它紧跟项目 github 页面上给出的示例。

对于这个 xml

这可以很好地打印出所有书籍，但是，书名是 NoneType ，我无法迭代输出或将它们强制到列表中。

如何使返回的输出成为字符串列表？

XML 文件的一部分：

我读取 xmlfile 的 python 代码：

使用 Program()，我将从 xml 文件中得到一个包含类型和代码标记的列表。

我现在正试图弄清楚如何从中取出 lang 标签并制作一个类似于上面的列表，但只有 Code 和 Lang 标签

我创建了一个新变量：

当我打印这个我得到一个错误

谁能说我做错了什么？请使用简单易读的python代码。我是一名学生，开始学习python。

谢谢

python脚本中的这一行：

生成此错误：

文件的第一行是：

我错过了什么？注意：开头的 BOM 在 linux 命令行中没有通过 head 显示（以上文字来自 Win10）。欢迎提出建议！以前从来没有用过 XML，我的运气今天结束了......

编辑：我能够通过首先打开（）文件来解决它，但这似乎应该是不必要的？

我已经使用 xmltodict 解析了一个 XML 文件，并且我发现了<coordinates>我希望从中提取 lat & long 值以添加到数据框的标记的路径。这是一个小样本：

路径如下。

这是一个非常长的 xml 文档，有 4 个Folder标签，但我只需要第一个中的值['Folder'][0]。我不知道该怎么做是遍历所有['Placemark'][n]直到提取所有坐标。

我已经尝试了几件事，最后一个在下面，这是尝试开始找到正确的标签。但无济于事。

追溯：

任何帮助表示赞赏。

我正在尝试使用使用 XML 的宁静界面。我已将 XML 库的选择范围缩小到两个。

根据文档，lxml.objectify 似乎是我的首选选项，但我很挣扎。

Xmltodict 似乎产生了更多的类型，并且可能不那么 Pythonic，但我似乎能够取得更多进展。

我有一个我用两者做的例子。Xmltodict 正在工作，但使用 xml.objectify 我似乎无法弄清楚如何访问/更改凭据的子元素。我的假设是我可以使用点符号来获取用户名和密码，但我没有成功。

一、xmltodict代码：

现在，lxml.objectify。

使用 lxml.objectify 我得到以下异常：

谁能指出我怎样才能让 lxml.objectify 工作？我应该坚持使用 xmltodict 吗？