问题标签 [uproot]

我正在尝试从 .root 导入 TH3 v3 文件，但收到以下错误消息：

如您所见，该对象可从根浏览器访问并具有边缘。

任何想法？uproot4 Ubuntu 20.04 vscode Insider 1.52 conda 4.9.2 python 3.9

我有一个 *.root 文件，我正在尝试使用 uproot (uproot4) 读入 Python。它看起来像这样：

如何读取 TMatrixT 类型？使用 .keys()、.values() 和 .items() 不起作用。

将数据读入笨拙的数组、pandas 数据框或 numpy 数组的正确方法是什么？

我目前正在尝试用 uproot 读取 ROOT 树，用 boost-histogram 记录和填充直方图，并将它们写回一个新的 ROOT 文件。这似乎对 bin 内容非常有效，但我似乎无法为最终 ROOT 文件中的直方图获得正确的 bin 错误。当我阅读这些直方图时，h.GetBinError(b)似乎等于h.GetBinContent(b)，而我想知道通常为 ROOT 直方图产生的熟悉的 sumW2 错误。我的工作流程如下，使用 python 3.8：

然后我使用 uproot4.iterate 遍历输入树，为每个“块”生成一个尴尬的数组，在此表示为e：

我不确定如何在构建提升直方图时获得 sumw2 权重，但根据文档，我将直方图定义更改为：

但是，当我运行我的代码时，这会导致该.to_numpy()行出现问题。错误说：“ what = uproot3_methods.convert.towriteable(what)”“ TypeError: cannot perform reduce with flexible type”

是否有其他方法可以将 sumW2 样式的错误从 boost-histogram 传播到在 uproot 中创建的 ROOT 文件？或者我对这个变量的理解可能存在错误storage=......任何帮助将不胜感激。

我有这个根文件，可以在 Google 驱动器的这个链接上找到，当我使用并行处理将它转换为根 3 中的数组时，它花费的时间和内存更少。我使用的代码类似于

但是现在它消耗了我在根 4 中的所有内存，可能是我做得不对。你能看一下吗？而且也没有以前那么快了。

@jpivarski 和我在这个链接的问题中讨论了这个问题，他建议它可能只增加 10% 的内存，但对我来说超过 10%。可能多出 60-80%

我正在尝试在 uproot4 中读取 TH1D 对象的一个​​分支。可以使用以下命令创建示例根文件：

连根拔起：

但是，当我尝试读取数组时，它会失败并出现很长的 Traceback。最后的电话是：

如果我设置 SetMakeClass(0); 在创建文件时，读取失败，而是：

使用 Python 2.7.18 和 3.8.6 解释器测试了 ROOT 6.22/06 和 5.34/21，连根拔起 4.0.5 和 4.0.6。难道我做错了什么？

我有一个根文件，其中包含一些 TDirectories 和 TEfficiency。我需要从中提取数据以进行进一步处理。

之后

我明白了

我在这里和这里检查过，但我不确定是否有解决方案。我正在使用连根拔起 3.4.15。有没有办法克服这个使用这个或另一个版本检索数据？

我在似然拟合中使用的讨厌参数之间有一个二维相关矩阵。我想把它翻译成 NumPy 以便与其他 vis 库一起使用。问题是TH2D.edges返回 bin 索引，我需要 bin 标签，即哪个 bin 是哪个讨厌的参数。该TH2D对象具有以下成员：

是否可以为每个索引提取 bin 标签？

我有这个 TParameter（准确地说是 Model_TParameter_3c_double_3e__v2），我试图通过它的“值”属性访问它，我已经看到通过这里的文档使用它

但这不起作用并吐出：

我还使用标准成员函数 GetVal() 通过 root 读取了它，那里的一切似乎都运行良好。

我错过了什么吗？干杯

我有一个看起来像这样的多索引熊猫数据框（称为 p_z）：

我希望能够根据另一个多维数据框（或 numpy 数组）选择某些行。它看起来像一个 pandas 数据框（称为 tofpid）：

我也把它当作一个尴尬的数组，它是一个 (26692, ) 数组（每个条目都有非标准数量的子条目）。这是一个选择 df/array，它告诉 p_z df 要保留哪些行。所以在 p_z 的条目 0 中，它应该保留子条目 0、2、4、5、7 等。

我找不到在熊猫中完成这项工作的方法。我是 pandas 的新手，甚至是 multiindex 的新手；但我觉得应该有办法做到这一点。如果它能够更好地广播，我将在大约 1500 个类似大小的数据帧上执行此操作。如果有帮助，这些数据框来自使用 uproot 导入的 *.root 文件（如果有另一种方法可以在没有 pandas 的情况下做到这一点，我会接受它；但我很想使用 pandas 来保持井井有条）。

编辑：这是一个可重复的示例（由 Jim Pavinski 的回答提供；谢谢！）。

这两个数据帧都是在 uproot 中本地生成的，但这将重现与 uproot 相同的数据帧（使用笨拙的库）。

我有一个包含一个 TTree 和 57 个分支的根文件。我想将其转换为只有 40 个分支的根文件，并更改它们的名称。我正在用python做这个。

解决这个问题的最佳方法是什么？我应该使用 uproot.recreate 创建一个新的根文件吗？如果是这样，如何使用来自 40 个旧分支的数据创建一个新的根文件，并更改分支名称？