问题标签 [taverna]

For questions regarding programming in ECMAScript (JavaScript/JS) and its various dialects/implementations (excluding ActionScript). Note JavaScript is NOT the same as Java! Please include all relevant tags on your question; e.g., [node.js], [jquery], [json], [reactjs], [angular], [ember.js], [vue.js], [typescript], [svelte], etc.

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java - 将 XML 数据插入 MySQL 数据库

我正在尝试将 XML 数据插入 MySQL 数据库。我编写的 SAX 解析器在测试时可以自行工作。但是,每当我尝试将记录插入数据库时​​,我都会收到 NullPointerException,即使我确保将值分配给为空的工作流元素。这是我的数据库表代码。包数据库;

这是我的带有插入记录语句的解析器代码。

有人可以告诉我为什么这给了我 NullPointerException 吗?提前致谢!!!

这是堆栈跟踪:

是的,workflow.xml 存在。下面是它的副本。

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ssh - 在 Taverna 中执行 Abaqus 模型

我对 Taverna 和 Abaqus 都很陌生,但我正在尝试在 HPC 上远程使用 Taverna 中的“工具”运行 Abaqus 模型。如果我已经有我的模型文件和 HPC 上的输入,这很好用,但我需要一种在 Taverna 中动态上传文件的方法(尝试一般地包装 Abaqus 模型)。

我尝试添加一个带有文件列表的输入端口,但我不知道如何将其复制到我为该工具设置的“位置”。beanshell 服务是否可以作为答案,或者我可以在执行 abaqus 模型之前遍历文件列表并复制它们?

谢谢

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taverna - 在 Taverna Workbench 中执行 SCUFL xml

我对工作流管理系统比较陌生,并且正在探索小酒馆。我了解 Taverna 工作台是用于构建和编辑工作流的 GUI,但如果我有一个 SCUFL xml,它是图形工作流所代表的底层语言,那么 taverna 工作台中是否有一个规定允许我直接导入和执行给定的XML ?

或者这是我必须用 taverna 命令行工具做的事情?,我试图在文档中找到它,但找不到参考。