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我正在使用 R 使用 RODBC 包从 MySQL 数据库中读取一些数据。然后处理数据并将一些结果发送回数据库。问题是服务器在大约一分钟后由于不活动而关闭连接，这是在本地处理数据所需的时间。它是一个共享服务器，因此主机不会增加超时时间。

我认为有两种可能解决这个问题 1）在每个数据库事务之前打开一个连接并在之后立即关闭它 2）每 30 秒左右向服务器发送一些小的“ping”命令，让服务器知道我在还在那里。

我可以很容易地实现第一个，但是不断打开和关闭连接似乎很慢。有人知道第二个有效的命令吗？还是完全有更好的方法？

使用 64 位 ODBC 驱动程序通过 DSN 连接到 Oracle 的 winxp64 位上的 Revolution R 64 位中的 RODBC 错误

我可以连接，但在查询内容时出现错误，以下内容也有效

但是如果我事先不知道 rowsize(max=1) 怎么办

谢谢，阿伦

简单的问题，但找不到答案。

代替：

我想要一段更动态的代码。就像是：

但这是不正确的。

在 Ubuntu 上安装 RODBC 包有点麻烦。首先，我学会了安装以下内容：

这还不够好，因为包仍在寻找头文件。我通过以下方式解决了这个问题：

很好，RODBC 已正确安装在 Ubuntu 机器上。但是当我尝试运行以下脚本时：

我收到一个错误，提示找不到函数 odbcConnectExcel。我检查了每个字母的大小写，确保它不是一个简单的错字。没有。然后我在 Windows R 安装上运行了相同的脚本（当然，文件路径不同）并且脚本有效。

知道为什么 Ubuntu R 安装找不到 odbcConnectExcel 函数以及如何让它工作吗？

关于此 R 代码的问题：

在这两种情况下（警告和错误部分几乎完全相同），代码对于错误（通过省略代码中所需的参数强制）都可以正常工作：我得到一个 NA 值和一个错误消息。

同样对于 sqlQuery 的错误（给出无效的 DSN）：NA 值和错误消息。

但不适用于 sqlQuery 的警告。没有消息输出，但df包含消息（所以没有 NA）。为什么？

我们将所有实验室数据保存在 Sybase 数据库中。当我想做数据操作和分析时，我使用 RODBC 将数据读入 R。

到目前为止一切顺利，除了 CGS.Specimen 是我们整个实验室所有的表格。有近 40000 个样本（行），有 66 个变量。阅读需要花费不必要的时间，尤其是当我只对一项拥有大约 1000 个标本的研究感兴趣时。解决它的明显方法是

但是当我跑步时，我得到了

[1] "42S22 -143 [Sybase][ODBC Driver][Adaptive Server Anywhere]Column not found: Column 'RP' not found" "[RODBC] ERROR: Could not SQLExecDirect 'SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode=\ "RP\"'"

我玩过引号，也玩过转义斜线，但可惜我一无所获。

例如

错误：“indivs <-sqlQuery(channellab,'SELECT * from CGS.Specimen WHERE StudyCode='RP”中出现意外符号

.Call(C_RODBCFetchRows, attr(channel, "handle_ptr"), max, buffsize, 中的错误：不允许负长度向量

你有什么建议？

I have developed an online survey that stores my data in a Microsoft SQL 2005 database. I have written a set of outlier checks on my data in R. The general workflow for these scripts is:

1. Read data from SQL database with sqlQuery()
2. Perform outlier analysis
3. Write offending respondents back to database in separate table using sqlSave()

The table I am writing back to has the structure:

As you can see, I've set the primary key to be modelid and reason. The same respondent may be an outlier for multiple checks, but I do not want to insert the same modelid and reason combo for any respondent.

Since we are still collecting data, I would like to be able to update these scripts on a daily / weekly basis as I develop the models I am estimating on the data. Here is the general form of the sqlSave() command I'm using:

where db is a valid ODBC Connection and db.insert has the form

sqlSave() chokes when it tries to insert a row that violates the primary key constraint and does not continue with the other records for the insert. I would have thought that setting fast = FALSE would have alleviated this problem, but it doesn't.

Any ideas on how to get around this problem? I could always drop the table at the beginning of the first script, but that seems pretty heavy handed and will undoubtedly lead to problems down the road.

我还有一个令人费解的问题。

我需要使用 RODBC 读取 .xls 文件。基本上我需要一张包含所有单元格的矩阵，然后使用 greps 和 strsplits 等来获取数据。由于每张工作表都包含多个不同顺序的表格，以及一些中间有其他选项的文本字段，我需要一些功能类似于的东西，readLines()然后是 excel 工作表。我相信 RODBC 是最好的方法。

我的代码的核心是以下功能：

然而，无论我尝试了什么，它总是将提到的工作表的第一行作为返回数据框的变量名。不知道如何解决这个问题。根据文档，colnames=FALSE应该防止这种情况。

我想避免xlsReadWrite包裹。编辑：和gdata包。客户端系统上没有 Perl，因此不会安装它。

编辑：

我放弃了，read.xls()从xlsReadWrite包裹里走了。除了名称问题外，事实证明 RODBC 不能真正读取带有斜杠等特殊符号的单元格。格式为“dd/mm/yyyy”的日期只是给出了 NA。

查看 sqlFetch、sqlQuery 和 sqlGetResults 的源代码，我意识到问题很可能在驱动程序中。不知何故，工作表的第一行被视为一些列特征，而不是普通单元格。因此，它们不是 colnames，而是等效于 DB 字段名称。这是您无法设置的选项...

我正在尝试使用 RODBC 将 Oracle 数据集市中的数据提取到 R 中。我已经能够解决我的一些问题，但我有一个基本问题。

如何保留数据库中的格式？

使用以下命令

我的数据按预期检索，但是当它们应该是字符时，某些字段在 R 中被转换为数字和逻辑一次。如果我使用，我可以解决这个问题：

但是当我希望它们成为日期时，我“丢失”了被格式化为日期的列。

有没有办法将 R 中定义的变量传递给 RODBC 包中的 sqlQuery 函数？

具体来说，我需要将这样的变量传递给标量/表值函数、存储过程和/或可能是 SELECT 语句的 WHERE 子句。

例如，让：

然后，

或者...

或者...

显然，这些都不起作用，但我认为有一些东西可以实现这种功能。