问题标签 [rjava]

最近 JRI 已成为 rJava 的一部分，如 www.rforge.net/JRI “因此，如果您只是想使用 JRI，请安装 rJava 二进制文件，一切就绪！”

也就是说，文档在哪里？“ http://cran.r-project.org/web/packages/rJava/rJava.pdf ”没有提到 JRI 相关的方法。我用谷歌搜索它没有运气。

项目死了吗？有人在使用它吗？他/她可以发表评论吗？有没有更好的选择？

光荣的http://www.omegahat.org/contents.html上的大多数链接也已失效。

在 Debian 64 位机器上更新到 R 3.0.1 后，不想安装 rJava 包。

配置失败，所以 sudo R CMD javareconf [这在另一台 debian 机器上工作]。但是在这里不起作用，其他人有这个问题吗？[见下面的终端输出]

java环境：

我使用这个名为“Rjms”的包，它是 RJava 的包装器，用于从 apache activeMQ 推送/消费。包中有一个名为“consume”的函数，我用来从队列中消费。问题是，一旦我打了那个电话，直到从队列中收到一条消息，应用程序就会被挂起。如果碰巧队列为空，则整个脚本将暂停。我想添加某种时间，这样如果消息在 5 分钟内没有出现，那么我想取消通话。

一旦在 R 中进行调用，它就会在内部调用一些 Java 函数（我假设）。因此，我不确定 R 是否可以完全中断这个过程。我正在阅读回调，这似乎是一个好主意，但找不到在 R 中使用的任何具体内容。我不确定是否可以给出一个可重现的示例，因为需要首先设置 Apache ActiveMQ。但总的来说，有没有一种方法可以摆脱不是 R 原生的函数调用？

任何帮助将不胜感激。

链接 - Rjms 包 - http://cran.r-project.org/web/packages/Rjms/Rjms.pdf

我正在使用 Java，我需要使用附加 R 库并使用该库中的函数。我尝试了以下问题中提供的答案

如何将 R 脚本加载到 JRI 并从 Java 执行？

在 Java/JRI 代码中加载 R 自己创建的库时出现问题

但我仍然得到一个 NullPointerException。谁能指出错误。谢谢

这是我正在使用的代码：

当我键入require(xlsx)以xlsx在 R 中加载包时，会显示以下消息：

我也尝试rJava手动加载包，但收到此错误消息：

你对如何解决这个问题有什么建议吗？

我使用包 xlsx 和函数 read.xlsx2() 将一些大型 xlsx 文件读入 R 中的 data.frame。这些文件大约有 10.000 行和 140 列。我将堆增加到 2 GB，因为该包使用 rJava 包来读取 xlsx 文件。问题是，在我读取了一个文件然后继续工作之后，R 仍在使用内存。我经常需要读取几个文件，并且在读取了两个 xlsx 文件后，我的内存再次耗尽（java.lang.OutOfMemory. ..)。读取文件后如何清除内存？经过大量谷歌搜索后，我相信这是因为 JVM 是通过 rJava 初始化的。如果我重新启动 R，内存将被清除（并通过保存图像来保留数据）。

我对Java一无所知，所以我希望有人可以帮助我。

编辑：我使用 R 3.0.0 64 位和 java 64 位以及带有 8 GB 内存的 Windows 7。只是为了澄清..如果我保存工作区并重新启动R，那么数据的内存使用情况看起来很正常。我认为（但我不确定）当解压 xlsx 文件时，内存问题就开始了。我知道我仍然可以增加堆大小，但我想限制内存使用量，所以我不需要在所有计算机上安装额外的内存。我也使用了 xlConnect 包，这里的内存问题是一样的。

/肯尼斯

我有一个非常大的 data.frame，它有 9000 个 obs。1600 个变量，我需要将其存储在 Excel 工作簿中。我已经尝试过XLConnect打包，但我得到了这个错误：

我还尝试通过以下方式设置 jvm 堆大小：

不幸的是，它没有用。此外，我试过write.csv()and write.table，但输出是错误的。还有其他方法吗？

我一直在尝试学习 rJava，以便在我编写的一组 Java 应用程序和 R 之间来回传递数据以进行分析。我有一个带有签名的 Java 方法

我在 R 中的内容如下

此时我的数据应该包含我需要使用的矩阵，但我不明白如何将数据从 Java 矩阵转换为 rJava 矩阵

数据[1]

返回

我努力了

我确信我所缺少的东西是显而易见的，但我就是无法让它发挥作用。

I have tried using this command to increase the memory availability for running MaxEnt in R :

as suggested by the dismo pacakge to increase the access to RAM but this then leads to a new error:

has anyone resolved this issue? Any advice would help.

Cheers Israel

我试图让 R 包“lsa”运行，而这又需要 Snowball，而后者又会失败。我正在运行 OpenSUSE 12.2 和最新的 R 补丁版本（当前为 3.01）。事情是这样的：如果我执行“sudo R”，库加载没有问题，但如果我尝试以好的方式运行 R，在 emacs ESS 模式下，我没有 sudo 并且尝试失败。这是我看到的：

这是一长串 rJava 问题的结论。

关于如何在没有 sudo 的情况下运行的建议（运行 sudo R 似乎很愚蠢，除了是 ESS 模式的问题）