问题标签 [pytables]

只是一个简单的问题，我如何让 pypy 识别我在 Python 中拥有的第三方模块？例如，我收到以下错误。

这基本上是说它在我试图运行的脚本中找不到我用来与之交互的 pytables 库。

如果没有，是否有任何方法可以加快我的 python 代码以在 64 位系统上访问 pytables（所以没有 psyco）？

我目前在尝试让 PyTables 更快地将数据写入自身时遇到了麻烦。让我解释一下我目前的情况。

现在我有通过多播传入的数据，数据率很高。我有一个解析器和一个数据结构，可以将数据散列到字典中，这些字典被发送并存储在 PyTables 中。

我有一个线程接受这个字典，它的键是和 id，它的值是应用于 id 的数据实例数组。线程遍历键值对并将数据添加到与 id 对应的表中。

这是我当前的实现，到目前为止，字典数组充当了随着时间线性增加的缓冲区。这是我明显的问题。该代码显示了编写器线程为写入数据而进行的常量循环。

我想知道是否可以在 pytables 中存储某种可以将 id 映射到组实例的字典？目前，我正在尝试将我的数据分组；但是，查找这些组的查找时间（通过 getNode 方法）需要很长时间。

我希望能够在文件中打开一个允许我查找组/表实例的字典，而不是在打开要读取的文件时调用 getNode 来搜索树以查找组。这是一种可能吗？

我尝试安装 PyTables 模块。我使用 Windows 7 (x32)、Python 2.7.3 (x32)、Cython 0.16、Visual Studio 2008 (9.0)。在 cmd.exe '以管理员身份运行' 写入：'python setup.py install --hdf5="C:\Program Files\HDF Group\HDF5\1.8.9"'。

但是有未解析的外部符号并且构建失败：

我正在使用 Pytables，想知道如何在文件夹中创建 h5 数据库。

例如，创建这样的数据库文件很容易：

这会在 python 目录中创建一个文件。如果我想在子文件夹中创建文件 test2.h5 怎么办？如何更改创建文件的目录？

我正在尝试将 Python 线程模块与 PyTables 一起使用。有人能告诉我 PyTabes 是否是线程安全的吗？我遇到了一些错误，它似乎与线程有关。

谢谢，马克

我一直在为一些大型金融数据集测试 pandas 和 pytables，并遇到了一个真正的绊脚石：

当存储在 pytables 文件中时，pandas 似乎将多维数据存储在非常长的行中，而不是列中。

尝试这个：

输出：

我不完全确定，但我认为结合错误消息，Array(2,100000000) 表示具有 2 行和 100,000,000 列的二维数组。这也是它在 HDFView 中的显示方式。

我一直在经历极其糟糕的表现（在某些情况下， data['ticks'].head() 需要 10 秒），这是什么原因？

尝试安装 Pytables，并且我已经安装了几乎所有依赖项：但是，当我尝试安装 pytables 时：

“不支持的 HDF5 版本”是什么意思？

对python来说相对较新，如果这有一个我没有找到的明显答案，请原谅。

我正在将一些临时连续的二进制文件读入 numpy 记录数组，最终目标是将它们存储在 pytable 中。我预计的问题是文件可能并不都具有相同的字段或相同的字段顺序。我一直在寻找一个numpy函数，它将使用字段标签或索引对recarray的列（而不是行）进行排序。当您将一个recarray附加到另一个时，更好的是一个为您执行此操作的函数 - 并考虑丢失的列。以下是我想到的示例：