问题标签 [pyhdf]

我有一个压缩的 HDF 文件 (HDF.Z)，想这样打开它：

为了获取我需要使用 pyhdf 的数据：

但是，这会导致错误消息：

有没有办法将此文件作为缓冲区打开以读取它？顺便说一句：什么是缓冲区？

我已经尝试并搜索如何解决这个问题，但仍然找不到如何从给定的 Modis Aqua .hdf 文件中读取和绘制 gdal 和 matplotlib 的方法。任何帮助深表感谢。顺便说一句，我在 Windows 7 中使用 Python 2.7.5。文件名是A2014037040000.L2_LAC.SeAHABS.hdf。在 hdf 文件的地球物理数据中，我只会使用 chlor_a。

更新：

这是示例文件的链接。

A2014037040500.L2_LAC.SeAHABS.hdf

I am trying to read an HDF4 file with my Anaconda python distributions on 64-bit Windows 7. I have tried to do a conda install of both the pyhdf and pyNio packages, but Anaconda seems to find neither. Does anyone have any advice on how to do this? I tried to add conda.binstar.org/mutirri to my .condarc file, but conda says it still can't find the packages....thanks!

我不知道如何读取以下 HDF 文件中包含的元数据。我可以成功读取数据集和属性，如下所示：

ftp://ladsweb.nascom.nasa.gov/allData/6/MOD07_L2/2014/126/MOD07_L2.A2014126.0640.006.2014126214544.hdf

我希望有一个人可以帮助我。

有谁知道如何修改以下代码，以便我可以在 Python 中读取 3D hdf 数据的特定 z 分量切片？从附图中可以看出，z 值从 0 到 160，我只想绘制“80”。尺寸为400x160x160。这是我的代码。

我对 python 和编程很陌生，都是自学的。去年年底我开始了一个新职位，要求我创建和维护大型科学数据集。一个很大的障碍是学习在 Windows 上为 64 位 python 2.7 安装 pyhdf 和 netcdf4 模块。这是如何做到这一点的。

我正在尝试使用 pippyhdf在 python3 中添加包。我在 virtualenv 中工作，并在那里有 prereq 包：

如果我要求 pip 获取 pyhdf 的最新/默认版本，我相信它会搜索此索引页面

这似乎使 pip 出错，因为它试图从当前没有响应的服务器 FTP v.0.7.x（不是最新的）的鸡蛋：

ftp://nordet.qc.dfo-mpo.gc.ca/pub/soft/pyhdf/pyhdf-0.7-1.tar.gz

我已经经历了'requests'包​​不接受像这样的FTP URL的整个混乱，并且pip现在强烈反对获取外部/未经验证的包，即使它们在PyPI中列出。我决定采用这种解决方法，直接从作者的网站获取最新版本：

wget http://hdfeos.org/software/pyhdf/pyhdf-0.9.0.tar.gz

要从下载的 egg 构建 python 包，您需要在运行 setup.py 之前获取 libhdf 的源头文件（通过 pip 或手动）。以下我在 venv 之外做了，尽管它们也可能在一个内部工作

最后，回到 venv，实际的 pip install 语法对我有用，可以从我下载的 tar.gz 安装 pyhdf：

之后pip list产生：

耶！

由于我发布了让我 pyhdf 好的解决方法，所以为了让这个问题成为一个实际的问题，我会问：用户是否可以通过官方适当的方式联系 PyPI 管理员或 pyhdf 包的作者来报告“项目页面上的“最佳匹配”链接是：

1. 不再是最新版本，并且
2. 指向一个明显离线（至少目前）的 FTP 服务器，pip install pyhdf如果没有太多额外的手动干预（如果是永久性的，应该由维护人员记录），基本上是不可行的

我目前正在处理HDF文件（第 4 版），并且我使用该pyhdf模块（http://hdfeos.org/software/pyhdf.php）。

当我使用 MATLAB 在 MATLAB 中打开我的一个 HDF 文件时nctoolbox，我得到以下变量：

使用 python，pyhdf我只看到 2 个变量：

如果有人可以帮助我弄清楚这里发生了什么。

我想每天从一个巨大的 hdf5 中选择一个数据子集。使用where 掩码是完美的，但我不能让它与 multiindex 一起工作（因为我必须有一个 where 有两个条件）。不能使用带有多索引的 where 掩码：

好的，现在我把它放在一个 hdf 商店

但如果我再读一遍，我有

这个索引是错误的。

所以我不能使用where 掩码。你能帮助我吗？

我已按照http://hdfeos.org/software/pyhdf.php中的说明详细说明了如何安装 pyhdf，随后尝试运行此站点上列出的示例代码（可在此处找到）。不幸的是，当我运行示例代码（我保存为 hdf.py）时，我收到以下错误消息：

有人看到类似的东西或有什么建议吗？如果有帮助，我正在 Mac OS 10.10.3 Yosemite 上运行。