问题标签 [jri]

我目前正在使用 Java 包 JRI，以便使用 R 提供的一些功能。

假设，我的 R 命令如下所示：

如果我将它放入我的 REngine.eval() 函数中，它会崩溃，因为我应该将整个命令输入到一个“eval()”命令中。它可以在我的普通 R 命令行中运行...

主要问题是，无论何时下一个订单是否拆分为多行，我都很难预测。那么，我该如何解决这个问题呢？

我想过计算括号，但括号的数量并不总是均匀的。（比方说，字符串中包含一些括号）还有其他想法吗？

编辑：我认为，我的观点不够明显。试试这个：

您会看到，对于前两个命令 a，您会收到

但其余的 b 是这样的：

一般来说，这是 R 的一个问题。通常这有效，但在 JRI 中无效！

I am trying to run an example of JRI and being unsuccessful, here is a link to the example. http://blog.comsysto.com/2013/07/10/java-r-integration-with-jri-for-on-demand-predictions/

This is the error the console gives me.

As far as I know I have the external JRI 2014-10-19 jar attached to the project correctly. I have R 3.1.2 installed and I have the rJava 0.9-6 package installed.

Line 10 is "rengine.eval(String.format("greeting <- '%s'", "Hello R World"));".

And Line 17 is "hello.helloRWorld();".

Please Let me know if you have an idea as to why it's throwing these exceptions.... :)

所以我试图通过 JRI 从 Java 中使用 R。我正在为 Eclipse 使用 RJava 插件，并且 rJava 附带的两个测试文件工作正常（rtest 和 rtest2）。但是当尝试运行这个简单的代码片段时，我得到一个 EXCEPTION_ACCESS_VIOLATION：

我得到的输出：

完整日志： http: //pastebin.com/18wHWihB

我在日志中看到了这个，它必须做些什么吗？（错误使用了 eval 函数？我只是复制了一个例子......）

如果有人可以提供帮助，我很茫然，将不胜感激:)

I use org.rosuda.jri lib to run an R script that implements the ordinary kirging algorithm via java. I use ubuntu 13.04 and the version 1.7-3 of REngine While all the results are perfectly produced BUT i can not create the plots and store them.

while the following lines are perfectly executed in R console

These ones are ignored

What i am missing??? Thanks for the dedicated time. :-)

在此代码中，变量xx返回 0 而不是 20，不应该计算它并将其值保留在 eval 之间吗？

这是结果：

我正在尝试在 R 中创建一个数据框，从 Java 中的 ArrayList 获取数据。

下面的代码似乎是官方的 JRI 测试套件（请参阅此链接），但它甚至没有编译，例如在第一条语句中 RList 没有 put 方法并且 REXP.createDataFrame 方法不存在。

有没有更新的例子REXP.createDataFrame？无法在线找到具体/功能示例。此外，找不到任何 JRI 文档。

更新

我发现有两个REXP类org.rosuda.JRI.REXP和 org.rosuda.REngine.REXP，后者有方法createDataFrame(l)，但是分配不起作用。如何将数据框分配给 R 变量？

我有这段简单的代码尝试加载 JRI 模块。

我将 java.library.path 作为 VM 参数传递，但 JRI 无法加载并出现以下错误：

在此先感谢您的帮助。

我有一个使用 JRI 调用 R 脚本的 Java 程序。在调用 re.eval("setMatValue('" + id + "'," + x + "," + y + "," + value + ")");时，我得到一个 java 内存不足异常，这对我来说很奇怪，因为 R 中的函数既没有返回任何类型的值，也没有将（不存在的）结果映射到 java 对象。矩阵仅存储在 R 上下文中并由字符串引用。

R 使用的内存是否包含在 Java 堆中？还是 JRI 分配了实际上不需要的空间？

对于更大的范围：我正在尝试将在 Java 中实现的代码分析所使用的矩阵的处理外包给 R。矩阵变得非常大，因此在 java 中占用了太多空间，我没有找到任何java中的矩阵实现能够创建该大小的矩阵。

我最近开始使用 JRI 在 Java 中运行 R 代码/脚本。尽管大多数语句看起来都可以正常工作（例如简单的赋值Test <- 123和特定的函数，如source(...) read.csv(...), rpart(...), data.frame(...)），但有一个函数总是会返回 null：predict(...)。

具体来说，我一直在尝试rengine.eval("prediction <- predict(fit, predict_entry, type = \"class\")");在“fit”和“predict_entry”都不为空且似乎包含有效值的情况下运行。然后，当我尝试运行rengine.eval("prediction")时，结果始终为空。

我不确定我是否错过了一些导致问题的库路径 - 请注意，相同的命令直接在 RStudio 控制台上运行良好。我的 java.library.path 和 R_HOME 的输出看起来也正确：

System.getProperty("java.library.path"):C:\Users\...\Documents\R\win-library\3.1\rJava\jri\x64;C:\Program Files\R\R-3.1.1\bin\x64

System.getenv("R_HOME"):C:/Program Files/R/R-3.1.1

有人对问题可能是什么有任何建议吗？请告诉我。

谢谢！

编辑：这是我错过的一些附加信息（感谢您指出 BondedDust！）

• 我的 rpart() 函数随基础 R 一起提供，并通过library(rpart)
• 创建“fit”的调用：fit <- rpart(Verdict ~ TestEvent1A + TestEvent1B + TestEvent2C, data=training_set, method="class")并通过 read.csv() 从 CSV 文件中读取 training_set；Verdict、TestEvent1A、TestEvent1B 和 TestEvent2C 是该 CSV 文件的列标题
• 非常好的调用 - 两者都terms(fit)从str(predict_entry)rengine.eval() 返回 [NULL ]; 然而，fit单独predict_entry返回[VECTOR ([VECTOR ([FACTOR {levels=("<leaf>","TestEvent1A","TestEvent1B","TestEvent2C"),ids=(2,3,0,2,0,0,1,3,0,0,0)}], [INT* (500, 409, 329, 80, 26, 54, 91, 68, 33, 35, 23)], [REAL* (500.0, 409.0, 329.0, 80.0, 26.0, 54.0, ...和[VECTOR ([FACTOR {levels=("1"),ids=(0)}], [FACTOR {levels=("5"),ids=(0)}], [FACTOR {levels=("3"),ids=(0)}])]分别 - 都包含我放入测试的数据。这可能是问题的根源吗？

编辑#2：我尝试在 RStudio 控制台上运行term(fit)并str(predict_entry)得到以下输出（不是 NULL！）

我正在使用 JRI 包来构建使用 catR 包的应用程序。在我的 Mac 上完美运行，但是当我在 Windows 上尝试时，函数 thetaEst 总是返回 null - 只有这个函数。是否有任何特定于 Windows 的配置..？

这是一段代码：

我在 theta.asDouble() 上得到了 NullPointerException；

任何人都可以帮助我吗？

提前致谢。