问题标签 [hydrogen]

我正在做一些基本的绘图程序（如下所示），在第一个文件运行后，我只会<Figure size 640x460 with 1 Axes>出现在输出区域中。然后在第二次运行代码时，实际会绘制图形。理想情况下，它会在第一次运行时绘制，因为稍后我想测试一些 matplotlib 样式的编辑。

我在 Hydrogen (Atom) 中使用 Python 3.6

我正在使用 Ubuntu 16.04 lts。我的默认 python 二进制文件是 python2.7。当我尝试在原子编辑器中为氢安装 ipykernel 时，使用以下命令

它给出了以下错误

我正在尝试为 python2 安装 ipykernel。我已经安装了python3.7。还安装了 ipython 和 jupyter notebook。

我想用更像 IDE 的感觉来替换Jupyter Notebooks 。

我偶然发现了Hydrogen，它是Atom Editor的插件。

它工作正常，但由于我使用Cookiecutter 目录布局，我总是遇到问题，即我从src文件夹运行的脚本需要其他导入而不是我在notebooks文件夹中使用的导入。

我尝试了很多其他插件，例如atom-python-run，但我遇到了同样的问题。根据脚本所在的目录，在未找到的地方导入。

通常会设置PYTHONPATH为添加更多文件夹供 Python 搜索，但我发现无法设置PYTHONPATH内部 Hydrogen（理想情况下以每个项目的方式）。`

我最近在我的笔记本电脑上安装了 Atom 作为 IDE，用于大学。我安装了 Hydrogen 作为一种方便的解决方案，以便在旅途中显示一些图。但是每当我运行 Hydrogen 时，我都会收到此错误：

但是 Matplotlib 在正常执行时可以正常工作，而 IPython 似乎也可以。这是我试图以测试方式运行的代码：

此处提供了该问题的视频。

• 已选中Run

• 产生的错误

我试图为深度学习/机器学习设置 WSL。我已经通过 WSL 安装了 Conda 环境。现在我想知道是否有任何方法可以设置 atom 的氢包来检测带有 ipykernels 的 conda 环境，这些环境在 WSL 中？

系统：

• 视窗 10
• Ubuntu 18.04 LTS
• Miniconda for python 3.7(安装在/home/)

已经尝试过：

• 使用python -m ipykernel install --user --name envName

谢谢

我是 Python 初学者，最近遇到了实现 Jupyter 笔记本的Atom编辑器和包。Hydrogen在意识到在 Chrome 中运行笔记本会消耗太多资源并且似乎有点慢后，我这样做了。

然而，Atom 编辑器和 Hydrogen 总是在代码中的一个小框架内输出打印（见图）。不幸的是，它不使用完整的窗口宽度。我也没有看到任何用于安装 pip 库的控制台/终端。

有没有办法在代码下方的控制台中输出，就像在 Jupyter 中一样，并有一个终端？

尝试从另一个文件/模块创建类的实例时，我在 MacOS 上的 Atom 中遇到了 Hydrogen 问题。该代码在命令行中运行时确实有效，但在 Atom 中则无效。我已经将启动内核的目录设置为“文件的当前目录”，这使我能够创建其他文件的对象并使用函数，但不能使用类。

这是两个各自文件中的代码。同样，导入 File2 不是问题，在 File1 中使用来自 File2 的函数也不是问题。只有类不起作用。

在 Atom 中运行时，运行 File1 会给我错误消息。

我的问题是每次我开始一个新项目时，我都需要在该项目的虚拟环境中安装一个 IPython 内核。这是一个问题，因为内核及其所有依赖项都在每个项目的 requirements.txt 中，即使它们仅用于开发而不是项目本身。例如，将一个简单的单页网站推送到 Heroku 只需要flask,gunicorn及其依赖项。但是因为我正在使用 Jupyter 进行开发，所以它最终也“需要”了 IPython 内核附带的所有包：

问题不完全是使用虚拟环境。我可以更改 Atom 中的环境，如果我从终端运行我的脚本，它就可以正常工作。但是当我尝试直接在 Jupyter notebook 中运行时，系统级内核看不到虚拟环境中的功能。

这是重现问题的方法。首先，创建一个虚拟环境。我使用pipenv，但也尝试virtualenvwrapper了相同的结果。然后，切换到环境。我尝试了两种方法并且都有效：

1. 正常启动 atom 并使用包 atom-python-virtualenv 选择我的虚拟环境（需要virtualenvwrapper-win和一些配置）。
2. 使用 pipenv，pipenv run atom .在 windows cmd 中运行。（一些 Atom 包现在可能会发现它们与该解决方案的依赖关系。我通过编辑它们各自的选项来解决这个问题，使其始终指向我系统的 python。）

通过这两种方法，我可以使用 atom 中的终端（我使用过）确认我处于正确的环境中platformio-ide-terminal，然后 install flask pip list # shows pip、setuptools 和 wheel pip install flask

最后，我启动了 IPython 内核。Hydrogen检测系统级别安装的内核，这正是我想要的。但是，如果我import flask在 .py 脚本中尝试，我会得到一个ModuleNotFoundError.

我想要的是内核检测我所处的环境，并查看该环境的包。换句话说 ：

1. 仅在我的系统环境中安装 Jupyter、内核和任何开发包
2. 发射原子/氢。因为它们是在系统级别安装的，所以它们应该能够随时看到 Jupyter 和我的内核。
3. 启动内核并让它看到系统环境中的包。
4. 杀死内核
5. 切换到没有 jupyter 或内核的新环境
6. 启动内核，它会检测新环境并仅查看该新环境中的包。

我正在考虑在启动时向内核发送参数以指示要使用哪个 Python 文件夹，但它会在它所在的文件夹中查找其初始化函数。

也许是符号链接？

我正在尝试在 Atom 上运行 Hydrogen，但在 asyncio python 库中收到一条以“NotImplementedError”结尾的错误消息。

我在 Windows 10 机器上安装了 Python3，并且我用 jupyter 安装了 ipython 内核。

我收到以下错误消息，我不确定从哪里开始解决问题。

回溯（最近一次调用最后）：文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\runpy.py”，第 192 行，在 _run_module_as_main 返回 _run_code(code, main_globals, None, File" C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\runpy.py”，第 85 行，在 _run_code exec(code, run_globals) 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\ Python\Python38\lib\site-packages\ipykernel_launcher.py”，第 16 行，在 app.launch_new_instance() 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\traitlets \config\application.py"，第 657 行，在 launch_instance app.initialize(argv) 文件中""，第 2 行，在初始化文件中"C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site -packages\traitlets\config\application.py”，第 87 行，在 catch_config_error 返回方法（app、*args、**kwargs）文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\ipykernel\kernelapp.py”中，第 469 行初始化 self.init_sockets() 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\ipykernel\kernelapp.py”，第 259 行，在 init_sockets self.init_iopub(context) 文件中“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\ipykernel\kernelapp.py”，第 267 行，在 init_iopub self.iopub_thread = IOPubThread(self.iopub_socket, pipe=True)文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\ipykernel\iostream.py”，第 68 行，在 init self._setup_pipe_in() 文件“C:\Users\chels \AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\ipykernel\iostream.py”，第 141 行，在 _setup_pipe_in self._pipe_in = ZMQStream(pipe_in, self.io_loop) 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py”，第 120 行，在 init self._init_io_state() 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py”中，第 541 行，在 _init_io_state self.io_loop .add_handler(self.socket, self._handle_events, self.io_loop.READ) 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\tornado\platform\asyncio.py” ，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader（文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py”，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedError\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py”，第 120 行，在 init self._init_io_state() 文件“C:\Users\chels\AppData \Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py"，第 541 行，在 _init_io_state self.io_loop.add_handler(self.socket, self._handle_events, self.io_loop.READ) 文件中“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\tornado\platform\asyncio.py”，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader（文件“C:\Users \chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py"，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedError\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py”，第 120 行，在 init self._init_io_state() 文件“C:\Users\chels\AppData \Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py"，第 541 行，在 _init_io_state self.io_loop.add_handler(self.socket, self._handle_events, self.io_loop.READ) 文件中“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\tornado\platform\asyncio.py”，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader（文件“C:\Users \chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py"，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedError\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py"，第 541 行，在 _init_io_state self.io_loop.add_handler(self.socket, self._handle_events, self .io_loop.READ) 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\tornado\platform\asyncio.py”，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader(文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py”，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedError\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\zmq\eventloop\zmqstream.py"，第 541 行，在 _init_io_state self.io_loop.add_handler(self.socket, self._handle_events, self .io_loop.READ) 文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\site-packages\tornado\platform\asyncio.py”，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader(文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py”，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedErrorpy”，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader（文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py”，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedErrorpy”，第 79 行，在 add_handler self.asyncio_loop.add_reader（文件“C:\Users\chels\AppData\Local\Programs\Python\Python38\lib\asyncio\events.py”，第 498 行，在 add_reader 中引发 NotImplementedError NotImplementedError

是否有一种简单的方法（一行代码甚至上下文菜单）来保存 Atom.io 编辑器中 Hydrogen 包的返回气泡中显示的图像？

实际上，我设法从检查气泡的开发人员窗格中提取了 png 的 base64 代码，这可用于生成图像。但是，这样做非常麻烦，使用 pyhton 保存图像更容易（见下文）。

备注：当然，由于是使用python生成图片，原则上可以通过注入python代码保存图片，但有时我只想保存生成的图片，而不返回包含代码的文件生成它。