问题标签 [fedora-commons]

我最近从 fedora-commons 3.7 升级到 3.8.1。我可以从 fedora-admin Web 面板搜索和获取对象，但是当我运行 /fedora/client/bin/fedora-admin.sh 并尝试搜索“*”时，我收到以下错误：

我以我的 fedora 用户身份运行 fedora-admin.sh。谢谢你的帮助。

我不清楚拥有 iRODS 或任何其他低级存储管理的实际优势。它到底有什么好处，我们应该什么时候使用它？

在具有普通文件系统低级存储的 Fedora-commons 中： 2009 年 5 月 8 日创建的数据流可能位于 2009/0508/20/48/ 目录中。

iRODS 在这里有何帮助？

我正在尝试对 fedora-commons 3.8.1 进行 REST 调用，但我不断收到“401 Unauthorized”错误。我用谷歌搜索，发现我需要确保：

在我所做的授权模块中设置。似乎很容易解决。我重新启动了我的服务器，但仍然得到同样的错误。

我需要帮助来解决这个问题。我无法将新数据流添加到 Fedora 存储库中的一些特定对象，但不知道这些对象的真正问题是什么。这是我得到的错误跟踪：

HTTP 代码 = 500，原因 = 内部服务器错误，正文 = javax.ws.rs.WebApplicationException：org.fcrepo.server.errors.ObjectNotFoundException：创建复制作业时出错：注册表中不存在请求的对象。

回溯（最后一次调用）：
文件“/opt/2.0/flx/pylons/flx/compress_upload_images.py”，第 159 行，运行中

obj.addDataStream(cDSName, fc.getDSXml(r.type.name), label=label, mimeType=h.safe_decode('%s' % mimeType), controlGroup=controlGroup, logMessage=h.safe_decode('存储压缩的%s ' % r.type.name))

文件“/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/fcrepo/object.py”，第 64 行，在 addDataStream 中

self.client.addDatastream(self.pid, dsid, body, **params)

文件“/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/fcrepo/client.py”，第 119 行，在 addDatastream 中

响应 = request.submit(body, **params)

提交中的文件“/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/fcrepo/wadl.py”，第 81 行

方法=self.method.name)

文件“/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/fcrepo/connection.py”，第 80 行，打开

返回 check_response_status(self.conn.getresponse())

文件“/usr/local/lib/python2.6/dist-packages/fcrepo/connection.py”，第 107 行，在 check_response_status

raise ex FedoraConnectionException: HTTP code=500, Reason=Internal Server Error, body=javax.ws.rs.WebApplicationException: org.fcrepo.server.errors.ObjectNotFoundException: 创建复制作业时出错：请求的对象在注册表中不存在.

我的意思是：我们如何知道容器的特定 URI 接受哪些请求以及我们可以使用哪些参数？

例如：容器 URI：http ://example.com/containers/container1

-> 现在我想知道一种访问容器元数据的方法。我该怎么做？

我试图问这个问题的主要原因是我正在将 Fedora Commons 从 3 迁移到 4。而且我对许多不同的模式和符号感到困惑。在某些地方，他们使用http://something.com/smthng/fcr:metadata. 在某些地方，他们使用http://something.com/smthng/metadata. 有时，fedora 命名空间会在 URI 中工作，而在某些地方则不起作用。我很困惑。

我想知道一种了解 URI 上所有公认约定的方法。

我已经设置了 solr、camel-toolbox:fcrepo-indexing-solr 并将 indexable 属性添加到存储库对象中。那么，我还需要设置 fuseki 或 sesame 还是单独设置 solr 就可以了？

我正在做一些交易，创建新对象或更新。但我在 solr 查询页面中找不到任何索引对象。

从 netstat，我可以看到来自 61616（JMS 端口）44863 和 44862（camel-solr-indexing 端口）的通信，反之亦然。

但没有与 solr 独立服务器通信。所以，我猜索引对象根本没有在 solr 中创建。

我在这里想念什么？

我可以找到两个日志：transaction.log 和 velocity.log。如果我在 Fedora 对象上完成的最近交易有任何条目，我想获取信息。但我什么也找不到。供您参考，velocity.log 的结尾如下：

.

.

.

2016-04-03 16:50:25,230 - ResourceManager：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/mode-root.vsl

2016-04-03 16:50:25,230 - ResourceManager：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/mode-root.vsl

2016-04-03 16:50:25,231 - 无法从 ResourceLoader org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 加载资源“/views/mode-repository.vsl”：ClasspathResourceLoader 错误：找不到资源 /views/模式存储库.vsl

2016-04-03 16:50:25,231 - 无法从 ResourceLoader org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 加载资源“/views/mode-repository.vsl”：ClasspathResourceLoader 错误：找不到资源 /views/模式存储库.vsl

2016-04-03 16:50:25,231 - 无法从 ResourceLoader org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 加载资源“/views/nt-base.vsl”：Classpat hResourceLoader 错误：找不到资源/views /nt-base.vsl

2016-04-03 16:50:25,231 - 无法从 ResourceLoader org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 加载资源“/views/nt-base.vsl”：Classpat hResourceLoader 错误：找不到资源/views /nt-base.vsl

2016-04-03 16:50:25,232 - 无法从 ResourceLoader org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 加载资源“/views/mix-created.vsl”：类 spathResourceLoader 错误：找不到资源 /views /mix-created.vsl

2016-04-03 16:50:25,232 - 无法从 ResourceLoader org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 加载资源“/views/mix-created.vsl”：类 spathResourceLoader 错误：找不到资源 /views /mix-created.vsl

2016-04-03 16:50:25,235 - ResourceManager：找到 /views/jcr-nodetypes.vsl 与加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader

2016-04-03 16:50:25,235 - ResourceManager：找到 /views/jcr-nodetypes.vsl 与加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader

2016-04-03 16:50:25,238 - ResourceManager：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/node.vsl

2016-04-03 16:50:25,238 - ResourceManager：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/node.vsl

2016-04-03 16:50:25,241 - 资源管理器：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/fcr-versions.vsl

2016-04-03 16:50:25,241 - 资源管理器：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/fcr-versions.vsl

2016-04-03 16:50:25,243 - 资源管理器：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/fcr-fixity.vsl

2016-04-03 16:50:25,243 - 资源管理器：使用加载器 org.apache.velocity.runtime.resource.loader.ClasspathResourceLoader 找到 /views/fcr-fixity.vsl

并且 transaction.log 仅包含以下内容：

2016-04-03 16:50:18,286 [main] INFO com.arjuna.ats.arjuna - ARJUNA012163：在端口 35848 上启动服务 com.arjuna.ats.arjuna.recovery.ActionStatusService

2016-04-03 16:50:18,298 [main] INFO com.arjuna.ats.arjuna - ARJUNA012337：TransactionStatusManagerItem 主机：127.0.0.1 端口：35848

2016-04-03 16:50:18,328 [main] INFO com.arjuna.ats.arjuna - ARJUNA012170：TransactionStatusManager 在端口 35848 和主机 127.0.0.1 上启动，服务为 com.arjuna.ats

.arjuna.recovery.ActionStatusService

但是端口 35848 上的 netstat 输出中没有正在运行的服务。

我已经在 karaf 安装了 fcrepo-indexer-solr。并尝试在 Fedora 存储库中创建新对象。然后我在 karaf 日志中发现了以下错误。

此外，如果我删除存储库中的任何对象，也不会出错。错误仅在我创建或更新任何对象时出现。我在这里想念什么？请建议。

我正在尝试使用 PUT 方法创建一个新对象，并使用 SPARQL 查询添加一些我自己的前缀。但是，正在创建的对象没有添加前缀。它适用于 POST 和 PATCH。为什么以及是否有 SPARQL 与 PUT 方法一起使用并使用用户定义的前缀添加的替代方法？

我的意思是insert根本没有添加子句中指定的所有上述值。

编辑1：

我尝试从 Web 控制台检查 solr 架构，但访问时也出现错误。从日志中：

这是一个难以解释的问题，也不希望有一个简单的答案，但认为值得一试。对可能会减慢与 Java 应用程序交互的长时间 Python 作业的原因感兴趣。

我们有一个 Tomcat 实例，它运行一个相当复杂且强大的 web 应用程序，称为Fedora Commons（不要与 Fedora 操作系统混淆），这是用于存储数字对象的软件。此外，我们有一个 python 中间件，它使用Celery执行长时间的后台作业。一项特殊的工作是摄取 400 多页的书，其中书的每一页都有一个大的 TIFF 文件，然后是一些较小的 PDF、XML 和元数据文件。在 10 到 15 分钟的过程中，从这些文件中创建衍生品，并将它们添加到 Fedora 中的单个对象中。

我们的问题：在摄取一本书的过程中，将文件添加到 Java 应用程序 Fedora Commons 中的数字对象的速度非常一致且可预测地变慢，但我不知道如何或为什么。

我认为摄取速度的图表可能会有所帮助，也许它掩盖了那些更熟悉 Java 的人可能会认识到的常见内存管理模式：

左上图是大 TIFF 的计时，被转换为 JP2，然后被摄取到 Fedora Commons。左下角是非常小的 XML 文件，没有衍生，也没有被摄取。如您所见，它们减速的曲线的斜率几乎相同。在右侧，这两个过程是一起绘制的。

我一直在互联网上试图了解 Java (GC) 中的垃圾收集，尝试不同的配置，但对减速没有太大影响。如果有帮助，这里有一些我们要传递给 Tomcat 的内存配置（我认为尾部主要是诊断性的）：

JAVA_OPTS='-server -Xms1g -Xmx1g -XX:+UseG1GC -XX:+DisableExplicitGC -XX:SurvivorRatio=10 -XX:TargetSurvivorRatio=90 -verbose:gc -Xloggc:/var/log/tomcat7/ggc.log -XX:+PrintGCDetails -XX:+PrintGCTimeStamps -XX:+PrintHeapAtGC'

我们正在12GB此 VM 上使用 RAM。

我意识到可能导致这种行为的因素有很多，请原谅双关语，超出图表。但是我们与 Fedora Commons 和我们的 Python 中间件合作已经有一段时间了，并且大部分都取得了成功。这种减速你也可以设置你的手表，只是感觉与 Java / 垃圾收集有关，尽管我也可能错了。

任何有关挖掘更多信息的帮助或建议都将不胜感激！