问题标签 [callr]

是否可以callr::r使用与当前使用的版本不同的 R 版本运行？一个示例是从 R3.5.1 调用以下内容，但使用 R3.4.1 执行它。

它应该返回类似“3.4.1”的内容。我已经研究过了callr:::setup_r_binary_and_args，但它需要当前的 R 版本。

尝试为 {disk.frame} 构建小插图时，我不断收到错误消息。我认为这是由于使用 NSE 的 {callr} 的错误行为。

是否可以不将 {callr} 与 RMarkdown 一起使用？我认为 {callr} 在后台创建了一个新的 R 会话，但如果我只是使用同一个会话来构建 Markdown，那么我应该没问题。但是我在 Rmarkdown 文档中找不到可以禁用 {callr} 的位置。

更新

这是您可以尝试的代码

我正在尝试构建一个在AWS ECS上运行并涉及包{future}、{future.callr}和{furrr}的 dockerized R 微服务（因此隐含{callr}和{processx}）

当我使用限制为1 个 CPU和650 MB内存的 docker 容器进行本地测试时（与我的客户的舞台设置相匹配；生产有1500 MB和4 个 CPU），一切正常。

但是，在实际的 AWS 实例上，我收到以下错误：

错误一：

错误2：

我在这里完全超出了我的深度，谁能给我一个提示，告诉我发生了什么和/或我该如何解决这个问题？

在这个问题上提供一个代表有点困难，但这里是一般设置的主要要点：

确保后台进程

处理两个操作“同时”发生的包装函数，其中每个操作需要在 3 个实体上并行化（x例如长度为 3）

每个并行化周期中要执行的实际功能

我正在尝试编写一个最小的 Shiny 应用程序来维护一个持久的外部后台进程。由于特定于全尺寸用例的原因，我在文本文件中跟踪 PID 而不是仅使用processx句柄。当我启动应用程序时，它看起来像这样：

当我按下“开始”按钮时，应用程序会创建一个后台进程并将 PID 记录在一个文本文件中。invalidateLater()重复读取文本文件并显示 PID 和状态的反应上下文。

该过程应该运行，直到我单击“停止”。但在初始化后不到一秒钟，该进程自行退出。

如果我删除invalidateLater()，该过程将继续运行。或者，如果我使用processx句柄而不是ps文本文件，则该应用程序可以工作，但这对于我的用例来说还不够。

应用代码

会话信息

编辑：垃圾收集

这是因为垃圾收集processx句柄。我可以用 2 个 R 会话来证明这一点。会话 1 创建一个后台进程。

会话 2 循环检查从会话 1 产生的后台进程。

TRUE会话 2 从每秒打印一次开始。但是当我rm(px); gc()在会话 1 中调用时，会话 2 打印FALSE。

我现在看到垃圾收集的终止是一个故意的功能processx：https ://github.com/r-lib/processx#features 。我猜在大多数情况下都是合理的。

在我的 R 代码中，我将另一个 R 脚本称为像这样的单独进程

记录器消息和任何错误都被写入同一个日志文件。但是错误消息写在文件顶部而不是写在页面底部

示例日志文件

在上面的示例日志文件中，当错误发生时，我希望在文件末尾打印错误

我也可以问一个子问题吗？为什么即使在代码中有错误之后仍然rp$get_exit_status()返回？zero

使用时我不一致地收到以下错误multidplyr（即，对于相同的数据，有时我会收到错误，有时不会）：

rs_init 中的错误（self、private、super、options、wait、wait_timeout）：无法启动 R 会话，超时

我的设置如下：

recursive_func_c调用的函数在哪里：

据我正确理解，multidplyr 集群由多个由callr. 我收到的错误消息似乎来自callr包。对于调试，我想为callrwithin设置更长的超时时间multidplyr。那可能吗？谢谢你的任何提示。

future.callr每次请求未来时，我都会使用它创建一个新线程（？），因此它是单独计算的，主 R 脚本可以继续前进。

当我的期货回来时，我收到以下警告：

在我正在运行的实际代码中，它只是加载一些数据，我不知道为什么（或关心编辑：我确实关心，请参阅下面的评论）它正在生成随机数。如何阻止显示该警告（修复 rng 生成或忽略它）？

我有很多关于期货的行，所以我希望能够以某种方式在开头设置选项，而不必将其添加到每一行。

这是一个示例，我试图忽略该警告。

我正在开发一个 R 包，并希望在后台运行正在开发的包中的一些功能，使用callr::r()或callr::r_bg().

例如，我创建了一个只有一个功能的包mytest

然后用 加载包pkgload::load_all()，使用devtools包加载开发中的包的功能。之后，我可以在控制台中运行该功能，但不能在后台使用callr::r().

另一方面，如果我安装包并运行library(mytest)，上面的代码运行没有问题

请，任何线索为什么callr::r()找不到功能mytest::hello()？

看起来load_all()没有将路径添加到可以找到包mytest的源代码的文件夹中。

我似乎有 NSE、rmarkdown 和 callr 的奇怪组合，类似于Is it possible to disable `callr` for RMarkdown? .

当我为变量设置一个值以在类似于使用 NSE 通过嵌套 eval 和列表调用实现的过滤器调用中使用它时，它会严重失败，但仅在 callr 中失败。

通过调用者运行它：

可以看到它的抱怨sig_cutoff是没有找到，但它存在于环境中，但似乎没有得到传递。

如果我直接运行它，它可以工作：

我已将所有代码放在github repo中。

有趣的是，这绝对是调用者的问题，因为目标也有同样的问题。

调用者 v 1.0.7，rmarkdown v 2.11，R 4.1.0

其他包版本在renv.lock文件中。

我需要测试包加载操作（对于我的多版本包）并且知道卸载命名空间和东西是危险的工作。所以我想在一个新的 R 会话中运行每个测试。并行运行我的测试不能满足这个需求，因为它会重用从站，并且这些会变脏。

所以我想callr::r会帮助我。不幸的是，我再次被记录在案的记者所困。

以下是一个最小的示例。放在文件中test-mytest.R。

我使用以下方法调用了这个测试文件：

这似乎可以满足我的要求，但是在查看结果时...

...这只是返回的第一个测试。

这个怎么运作：

• 执行普通测试。
• 获取当前使用的记者（-- 1 --）
• callr::r用于调用包含测试的测试块。
• 在通话中，我尝试使用set_reporter，但with_reporter实际上是相同的。
• 呼叫返回记者（用callr::r尝试过get_reporter()，但with_reporter也返回记者（隐形））

现在返回的记者似乎很好，但是当将其设置为实际的记者时set_reporter，似乎并没有覆盖实际的记者。

请注意，在 处-- 2 --，reporter_out包含两个测试结果。

问题

我不确定我希望它做什么，但最后我希望将结果添加到原始报告器（（summary或）reporter_in，也就是说，如果那不是某种副本）。