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R Markdown、Knitr、Pandoc、Bookdown的功能有什么关系？

.Rnw具体来说，在将带有嵌入式 R 代码（例如or .Rmd）的标记文档转换为最终输出（例如.pdfor ）时，这些包之间的“分工”是什么.html？如果使用 Knitr 来处理 RMarkdown，这个rmarkdown包有什么作用，它与markdown package?

我想使用 bookdown 将一系列.Rmd文件解析成一本书。如果我将我.Rmd的文件与主文件放在同一目录中，index.Rmd那么一切正常且花花公子。但是，这些.Rmd文件是从另一个来源自动生成的，我想将输入文件保存在子目录中。有可能这样做吗？

我可以在其中包含文件名，_bookdown.yml但我不希望每次.Rmd添加新文件时都更新该文件。

当前版本_bookdown.yml看起来像这样

我可以在脚本中移动文件，但希望它bookdown本身可以实现。

Bookdown 是一个很棒的软件包，我期待看到它是如何开发的，但是现在pdf_document2当数字在附录中时，我在以格式呈现数字数字时遇到了麻烦。具体来说，当带有标题的图在附录中时，图号应为 A.1、A.2、B.1、B.2 等形式，但图号被视为具有数字 3.1 的正常部分， 3.2、4.1、4.2等，其中附录分别为第三节和第四节。这是一个例子：

这是 bookdown 本身的问题，还是在某些方面不正确？

为了方便读者，我想在我的 bookdown 书的末尾，用 markdown 写一个简单的列表或书体定义的索引。即使用自定义块创建的，如下所示：

（我需要定义，但其他人可能喜欢定理列表等。不知道是否可以以相同的方式涵盖图形和表格列表？）

感谢@yihui，我知道那knitr::all_labels(engine == 'definition')是我的朋友。

所以我可以在本书末尾的任何地方执行此操作，通常在末尾：

打印这个：

带有可点击的数字。这没关系。但是，如果在每个标签之后，也可以打印实际定义，那不是很好吗？（块的内容在 knitr::all_labels(engine == 'definition') 中不可用）

我开始使用 bookdown 来生成更长的报告，但是因为我想自定义 pdf 输出而遇到了一些麻烦。 在文件\documentclass[]{}中不起作用。preamble.tex我认为该命令是由 pandoc 事先以某种方式执行的，不幸的是，到目前为止我还没有找到如何将选项传递给它。

我解决了一些问题，例如通过设置字体大小， \usepackage[12pt]{moresize}但我想知道如何正确访问设置选项。bookdown 文档没有详细介绍这个主题，我无法理解。

Bookdown 有许多配置选项，我发现很难理解如何知道一个选项是否存在，以及这些选项背后的逻辑。

具体来说，鉴于至少有两个其他地方可以说明选项，我发现很难描述其中的选项类型：_bookdown.yml

• 在_output.yml,
• 函数调用的参数，例如bookdown::render_book.

在我看来，_bookdown.yml函数的参数和参数之间没有任何类型的 1 对 1 映射bookdown::render_book，因此_bookdown.yml似乎不仅仅是将选项记录到函数调用的不同方式。

我们可以在源代码中看到 `_bookdown.yml' 控制了一些配置选项，但不是全部。

所以 - 重新表述这个问题 - 为什么是_bookdown.yml一个单独的配置文件以及它应该包含的内容的定义在哪里/是什么？

举一个有代表性的例子，有一个chapter_name选项可以用于_bookdown.yml. 我有以下问题：

1. 我们怎么知道这是一个选项，因为这里的文档甚至这里的示例中都没有引用它。
2. 一旦我们知道它存在，我怎么知道它有什么影响？所有这些选项是否都传递给其他包（例如 pandoc、rmarkdown）？我唯一能找到参考的地方是bookdownchapter_name的 CRAN 源代码，即使在那里我也无法真正弄清楚它是如何使用的。

请注意，_bookdown.yml作者的讨论是here，但我仍然不完全理解。

我正在尝试创建我的第一个 R Bookdown。我创建了一个项目并创建了两个 .RMD 文件。我正在尝试构建项目，但我在构建菜单选项下看到的只是Configure Build Tools. 没有实际构建项目的选项。我需要做什么？

如果我在第一个下面添加一行_output.yml：

在bookdown-demo中，输出变成了一个.html看起来很丑陋的文件。是否有可能保留默认设置产生的漂亮样式但在单个文件中？如果我想将这本书发送给其他人，则发送一堆文件并不是很好，尤其是如果接收它的人不熟悉 HTML 作为一种文档格式。

Bookdown 的传单地图中控制按钮的默认样式不符合我的口味，我想更改它。具体来说，我想删除右上角控制按钮的透明度，并确保按钮图像正确显示。

它目前的样子：

我想要的是：

编辑 1：可以在此处找到本文档的实时版本。

查看源代码后，似乎负责透明度和丢失图像的 css 样式是：

这来自 和 中的 csslibs/gitbook-2.6.7/css/style.css:9文件libs/gitbook-2.6.7/css/style.css:16。

我想请教的两个问题：

• bookdown 用户应该编辑什么 css 文件来自定义他们的书的外观？[编辑2：回答：./css/style.css]
• 需要什么特定的 css 命令来阻止图像全屏按钮图像消失？

谢谢！

编辑 2：按照此答案中提供的建议，我能够调整background-color控制按钮的 。这样就解决了透明度问题。我似乎仍然无法显示全屏按钮图像 - 我尝试过设置background-image: initial;，但这并没有改变它。欢迎提出建议。

我们正在尝试编写托管在https://github.com/guilhermejacob/context/上的书籍出版物

我尝试从我的中删除不同的条目book.bib，每次都会收到以下错误。该bookdown::tufte_html_book命令没有问题，尽管我的引文文件bookdown::pdf_book似乎没有问题，但对我来说只有死亡？book.bib

https://github.com/guilhermejacob/context/blob/master/book.bib

我用谷歌搜索，所有的 tex 问题都指向缺失author=或year=或title=标签之类的东西，而我的每个条目都有它们。

当我有一个空的 book.bib 文件时，我得到了同样的错误，所以文件夹中的其他内容必须配置不正确？但我不知道去哪里看，因为 natbib 似乎与 book.bib 有问题？我会很感激任何关于尝试什么的指示..谢谢