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我正在尝试将我的 C 项目从顺序编程转变为并行编程。尽管现在大部分代码都为此目的从头开始重新设计,但随机数的生成仍然是其核心。因此,随机数生成器 (RNG) 的性能不佳会严重影响程序的整体性能。

我写了一些代码行(见下文)来显示我所面临的问题,而且没有太多冗长。

问题如下:每当线程数 nt 增加时,性能就会明显变差。在这个工作站(linux 内核 2.6.33.4;gcc 4.4.4;intel quadcore CPU)上,在 nt=4 的情况下,并行 for 循环的完成时间比在 nt=1 情况下的时间长大约 10 倍,无论迭代次数 n 多少。

这种情况似乎在这里有所描述,但重点主要是fortran,一种我知之甚少的语言,所以我非常感谢一些帮助。

我尝试按照他们的想法创建不同的 RNG(具有不同的种子)以供每个线程访问,但性能仍然非常糟糕。实际上,每个线程的这个不同的种子点也让我感到烦恼,因为我看不出如何保证最终生成的数字的质量(缺乏相关性等)。

我已经考虑过完全放弃 GSL 并自己实现一个随机生成器算法(例如 Mersenne-Twister),但我怀疑我以后会遇到同样的问题。

非常感谢您的回答和建议。请务必询问我可能忘记提及的任何重要事项。

编辑:实施了 lucas1024(pragma for-loop 声明)和 JonathanDursi(播种;将“a”设置为私有变量)建议的更正。在多线程模式下性能仍然非常缓慢。

编辑 2: Jonathan Dursi 建议的实施解决方案(见评论)。

    #include <stdio.h>
    #include <stdlib.h>
    #include <time.h>
    #include <gsl/gsl_rng.h>
    #include <omp.h>

    double d_t (struct timespec t1, struct timespec t2){

        return (t2.tv_sec-t1.tv_sec)+(double)(t2.tv_nsec-t1.tv_nsec)/1000000000.0;
    }

    int main (int argc, char *argv[]){

        double a, b;

        int i,j,k;

        int n=atoi(argv[1]), seed=atoi(argv[2]), nt=atoi(argv[3]);

        printf("\nn\t= %d", n);
        printf("\nseed\t= %d", seed);
        printf("\nnt\t= %d", nt);

        struct timespec t1, t2, t3, t4;

        clock_gettime(CLOCK_PROCESS_CPUTIME_ID, &t1);

        //initialize gsl random number generator
        const gsl_rng_type *rng_t;
        gsl_rng **rng;
        gsl_rng_env_setup();
        rng_t = gsl_rng_default;

        rng = (gsl_rng **) malloc(nt * sizeof(gsl_rng *));

            #pragma omp parallel for num_threads(nt)
        for(i=0;i<nt;i++){
            rng[i] = gsl_rng_alloc (rng_t);
            gsl_rng_set(rng[i],seed*i);
        }

        clock_gettime(CLOCK_PROCESS_CPUTIME_ID, &t2);

        for (i=0;i<n;i++){
            a = gsl_rng_uniform(rng[0]);
        }

        clock_gettime(CLOCK_PROCESS_CPUTIME_ID, &t3);

        omp_set_num_threads(nt);
        #pragma omp parallel private(j,a)
        {
            j = omp_get_thread_num();
            #pragma omp for
            for(i=0;i<n;i++){
                a = gsl_rng_uniform(rng[j]);
            }
        }

        clock_gettime(CLOCK_PROCESS_CPUTIME_ID, &t4);

        printf("\n\ninitializing:\t\tt1 = %f seconds", d_t(t1,t2));
        printf("\nsequencial for loop:\tt2 = %f seconds", d_t(t2,t3));
        printf("\nparalel for loop:\tt3 = %f seconds (%f * t2)", d_t(t3,t4), (double)d_t(t3,t4)/(double)d_t(t2,t3));
        printf("\nnumber of threads:\tnt = %d\n", nt);

        //free random number generator
        for (i=0;i<nt;i++)
            gsl_rng_free(rng[i]);
        free(rng);

        return 0;

    }
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1 回答 1

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问题出在第二个#pragma omp 行。第一个 #pragma omp 产生 4 个线程。之后,您应该简单地说#pragma omp for - 而不是#pragma omp parallel for。

使用当前代码,根据您的 omp 嵌套设置,您正在创建 4 x 4 线程,它们正在执行相同的工作并访问相同的数据。

于 2012-03-29T00:11:08.083 回答