r - 无法在 R/Bioconductor 中获得 IRange 的最终值

Question

我是 IRanges 包的新手，无法获得 IRange 的最终价值。我能够毫无问题地获得开始和宽度值，这让我有点困惑，并且我的结束的大小写/拼写与标题行匹配。有没有其他人遇到过这个，或者可以请发现我做错了什么？谢谢，非常感谢！

library(IRanges)
> test=IRanges(100645,100664)

> test
IRanges of length 1
 start    end width
[1] 100645 100664    20

> test@start
[1] 100645

> test@width
[1] 20

> test@end
Error: no slot of name "end" for this object of class "IRanges"

Answer 1

访问 IRange 对象的字段的最简单方法是使用辅助函数start()：end()和width()。这些将返回一个包含相应列的所有元素的向量。

Answer 2

没有使用该软件包的经验，但基于?"class:Ranges"：

end(test$ranges[1])

它还有助于将来提供可重复的样本数据。