r - 是否有将 network() 或 igraph() 网络转换为在 R 中兼容的 Rgraphviz 的包？

Question

花费大量时间将网络格式化为 SNA 和 igraph 包中用于分析的格式。这些和 Rgraphviz 所需的数据类型之间是否有桥梁？我的意思是，保留：源到目的地、标签、边缘权重、颜色等其他属性。

Answer 1

是的，在igraph 文档中非常容易且清楚地显示：

write.graph(mygraph, file="filename", format="dot")

Answer 2

我没有找到任何要转换igraph的包Rgraphviz，但是，这是一种不保存文件的方法。该函数graph::graphAM接收一个邻接矩阵，可以通过igraph使用该函数获得igraph::get.adjacency。

使用这种方法，如果您有任何链接到节点或边的功能，您将需要单独添加它们。

library(tidyverse)

# Create the Data
actors <- data.frame(name=c("Alice", "Bob", "Cecil", "David",
                        "Esmeralda"),
                 age=c(48,33,45,34,21),
                 gender=c("F","M","F","M","F"))
relations <- data.frame(from=c("Bob", "Cecil", "Cecil", "David",
                           "David", "Esmeralda"),
                    to=c("Alice", "Bob", "Alice", "Alice", "Bob", "Alice"),
                    same.dept=c(FALSE,FALSE,TRUE,FALSE,FALSE,TRUE),
                    friendship=c(4,5,5,2,1,1), advice=c(4,5,5,4,2,3))

# Create the igraph object
g <- igraph::graph.data.frame(relations, directed=TRUE, vertices=actors)

# transform igraph object in graph which will be used in Rgraphviz
graph::graphAM(igraph::get.adjacency(g) %>% as.matrix(),
           edgemode = 'directed') %>%
  Rgraphviz::layoutGraph() %>%
  Rgraphviz::renderGraph()