我正在尝试使用 roxygen2 在 R 包中记录一些数据集。仅考虑其中之一：
- 我有
mypkg/data/CpG.human.GRCh37.RDa - 其中包含一个名为
CpG.human.GRCh37 和一个名为: 的文件
mypkg/R/cpg-data.R，其中包含：#' @name CpG.human.GRCh37 #' @title CpG islands - human - genome build: GRCh37/hg19 #' @description This data set list the genomic locations of human CpG islands, #' with coordinates based on the GRCh37 / hg19 genome build. #' @docType data #' @usage CpG.human.GRCh37 #' @format a \code{RangedData} instance, 1 row per CpG island. #' @source UCSC Table Browser #' @author Mark Cowley, 2012-03-05 #' @export NULL
当我 roxygenize 时，它会被创建mypkg/man/CpG.human.GRCh37.Rd，其中包含：
\docType{data}
\name{CpG.human.GRCh37}
\alias{CpG.human.GRCh37}
\title{CpG islands - human - genome build: GRCh37/hg19}
\format{a \code{RangedData} instance, 1 row per CpG island.}
\source{
UCSC Table Browser
}
\description{
This data set list the genomic locations of human CpG
islands, with coordinates based on the GRCh37 / hg19
genome build.
}
\author{
Mark Cowley, 2012-03-05
}
\usage{CpG.human.GRCh37}
\keyword{datasets}
并export(CpG.human.GRCh37)添加了NAMESPACE文件。
但是当R CMD CHECK我得到：
...
** testing if installed package can be loaded
Error in namespaceExport(ns, exports) :
undefined exports: CpG.human.GRCh37
Error: loading failed
...
我没有告诉 R 在哪里可以找到这个数据集，尽管我认为这mypkg/data/<name>.RDa将是一个很好的初步猜测。任何提示都会很棒。
如果 Hadley 正在观看，我注意到没有创建 \usage 部分并且忽略了 @usage 指令。
我在 R 2.13.1 上使用 roxygen-2.2.2