python - 使用 networkX 和 matplotlib 绘制一个巨大的图形

Question

我正在使用 networkX 和 matplotlib 绘制一个包含大约 5K 个节点的图形。matplotlib 的 GTK 窗口具有缩放和可视化图形的工具。有什么办法，我可以保存放大版本以便以后进行适当的可视化？

import matplotlib.pyplot as plt
import networkx as nx

pos=nx.spring_layout(G)   #G is my graph

nx.draw(G,pos,node_color='#A0CBE2',edge_color='#BB0000',width=2,edge_cmap=plt.cm.Blues,with_labels=True)
#plt.show()
plt.savefig("graph.png", dpi=500, facecolor='w', edgecolor='w',orientation='portrait', papertype=None, format=None,transparent=False, bbox_inches=None, pad_inches=0.1) 

Answer 1

您有两个简单的选择：

提高 DPI

plt.savefig("graph.png", dpi=1000)

（较大的图像文件大小）

另存为 PDF

plt.savefig("graph.pdf")

这是最好的选择，因为最终的图形没有光栅化。理论上，您应该能够无限放大。

Answer 2

虽然不在 GTK 中，但您可能想查看NetworkX Viewer。

Answer 3

您可能想检查一下：

plt.savefig("name.svg")

质量很棒。虽然 dpi 选项仍然有效。