13

我需要帮助，因为我不是编程专家。

对于具有n个节点和E条边的给定图，我如何绘制平面图（如果可以在平面中绘制没有边交叉的图，则称该图是平面图）。然后翻转边缘以获得另一个平面图。（for循环，直到我们获得所有可能性）。

在此先感谢，感谢您的帮助。

PY

>>>#visualize with pygraphviz
    A=pgv.AGraph()
    File "<stdin>", line 6
    A=pgv.AGraph()
    ^
    SyntaxError: invalid syntax
>>> A.add_edges_from(G.edges())
    Traceback (most recent call last):
    File "<stdin>", line 1, in <module>
    NameError: name 'A' is not defined
>>> A.layout(prog='dot')
    Traceback (most recent call last):
    File "<stdin>", line 1, in <module>
    NameError: name 'A' is not defined
>>> A.draw('planar.png')
    Traceback (most recent call last):
    File "<stdin>", line 1, in <module>
    NameError: name 'A' is not defined
4

1 回答 1

23

您的问题涉及几个困难的计算问题。

首先，一些理论。如果图 G 是平面的，则 G 的每个子图都是平面的。从 G 翻转边（有e边），将给出2^e-1平面子图（如果我们不关心连通性），这是指数的（即巨大的和“坏的”）。可能，您想找到“最大”平面子图。

如果您想绘制看起来也像平面的平面图在计算上是困难的，即知道存在边缘不交叉的图形表示是一回事，而找到这样的表示是另一回事。

要执行。似乎 networkx 没有检查图形是否为平面的功能。其他一些与图一起工作的包有（例如，sage有g.is_planar()函数 whereg是一个图对象）。下面，我根据Kuratowski 定理用 networkx 编写了一个“简单”（必须有更有效的方法）平面性检查。

import pygraphviz as pgv
import networkx as nx
import itertools as it
from networkx.algorithms import bipartite

def is_planar(G):
    """
    function checks if graph G has K(5) or K(3,3) as minors,
    returns True /False on planarity and nodes of "bad_minor"
    """
    result=True
    bad_minor=[]
    n=len(G.nodes())
    if n>5:
        for subnodes in it.combinations(G.nodes(),6):
            subG=G.subgraph(subnodes)
            if bipartite.is_bipartite(G):# check if the graph G has a subgraph K(3,3)
                X, Y = bipartite.sets(G)
                if len(X)==3:
                    result=False
                    bad_minor=subnodes
    if n>4 and result:
        for subnodes in it.combinations(G.nodes(),5):
            subG=G.subgraph(subnodes)
            if len(subG.edges())==10:# check if the graph G has a subgraph K(5)
                result=False
                bad_minor=subnodes
    return result,bad_minor

#create random planar graph with n nodes and p probability of growing
n=8
p=0.6
while True:
    G=nx.gnp_random_graph(n,p)
    if is_planar(G)[0]:
        break
#visualize with pygraphviz
A=pgv.AGraph()
A.add_edges_from(G.edges())
A.layout(prog='dot')
A.draw('planar.png')

编辑2。如果你在使用 pygraphviz 时遇到麻烦，尝试使用 networkx 进行绘制，也许你会发现结果还可以。因此，不要使用“使用 pygraphviz 进行可视化”块尝试以下操作：

import matplotlib.pyplot as plt
nx.draw(G)
# comment the line above and uncomment one of the 3 lines below (try each of them):
#nx.draw_random(G)
#nx.draw_circular(G)
#nx.draw_spectral(G)
plt.show()

编辑2结束。

结果看起来像这样。随机平面图

您会看到图片上有一个交叉点（但图形是平面的），这实际上是一个很好的结果（不要忘记这个问题在计算上很困难），pygraphviz 是使用启发式算法的Graphviz的包装器。在该行中A.layout(prog='dot')，您可以尝试将 'dot' 替换为 'twopi'、'neato'、'circo' 等，看看是否能获得更好的可视化效果。

编辑. 让我们也考虑一下您关于平面子图的问题。让我们生成一个非平面图：

while True:
    J=nx.gnp_random_graph(n,p)
    if is_planar(J)[0]==False:
        break

我认为找到平面子图的最有效方法是从“坏小调”（即 K(5) 或 K(3,3)）中消除节点。这是我的实现：

def find_planar_subgraph(G):
    if len(G)<3:
        return G
    else:
        is_planar_boolean,bad_minor=is_planar(G)
        if is_planar_boolean:
            return G
        else:
            G.remove_node(bad_minor[0])
            return find_planar_subgraph(G)

行动：

L=find_planar_subgraph(J)
is_planar(L)[0]
>> True

现在你有一个非平面图 G 的平面子图 L（一个 networkx 图对象）。

于 2012-02-07T13:39:11.820 回答