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我分析了许多城市（数百个）的测量结果，并且需要为每个城市创建单独的报告（以 Adob​​e pdf 格式）。

我的过程是这样的：

  1. 首先 RStudio 准备要显示的数据，保存在 X.Rda 中。
  2. 在 X.Rnw (RStudio) 中，我阅读 X.Rda，选择一个城市，然后生成表格和绘图。
  3. 在 RStudio 中，我按“编译 PDF”并生成城市报告 X.pdf。
  4. 我转到第 2 步，选择另一个城市，依此类推。

这非常乏味，看起来非常适合每个城市的 for 循环，但如何做到呢？

感谢 r 贡献者！

/克里斯

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您可以使用诸如带有全局变量更改的循环之类的东西for，它可以控制要编织到报告中的城市；请参阅其他帖子使用现有 R 会话中的对象运行 Sweave 或 knitr

代码将是这样的（假设cities是一个字符向量，我以knitr包为例，因为你可以指定输出的文件名）：

for (city in cities) {
   knit('city_template.Rnw', output = paste('report_', city, '.tex', sep = ''))
}

在里面city_template.Rnw，你有一个像

<<do-my-job>>=
make_plot(city, ...)
whatever(city, ...)
@

然后你会得到一系列由城市命名的tex文件，剩下的工作就是将它们编译成PDF（RStudio不可能编译多个tex文件，AFAIK，但在命令行或在 R 中，带有texi2dvi())。

您需要注意一件事——您必须fig.path为每个输出文件使用不同的数字前缀（选项），否则不同的城市可以覆盖彼此的数字输出。在knitr中，这可以通过以下方式完成：

<<setup, echo=FALSE>>=
opts_chunk$set(fig.path = paste('my-prefix-', city, sep = ''))
@

我相信这应该可以安全地生成许多带有循环的报告。

顺便说一句，您当然可以使用 Sweave 实现相同的目标；也许你会知道我后来为什么开发knitr（这是题外话，所以我不会在这里展开）。

于 2011-12-15T17:18:18.363 回答
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  • 在 R 环境中执行此操作。
  • 将特定城市的所有输出放在一个列表中
  • 用块写你的 RnW 只是调用输出
  • 将您的 R 图像保存在与 Sweave 报告相同的文件夹中，并将 wd 设置为相同的文件夹
  • Sweave("yourfile.RnW", output = "yourcity.tex")
  • 使用 texi2dvi 从 R 编译你的 tex 文件

如果你有很多城市，你应该把它放到一个函数中。

于 2014-02-12T09:19:31.837 回答