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在我们的服务器上，R 2.12.1 按照http://cran.r-project.org/bin/linux/debian/上的说明安装，使用apt-get install等。

由于某些情况，旧的 lenny 机器尚未更新到新的稳定版 debian，而且看起来这不会很快发生。由于这里的一些研究依赖于最新版本的 VGAM，我们需要在 debian 上安装 R 2.14.0。但为了让旧代码继续运行，我们不能只删除 R 2.12.1（在此版本上安装 VGAM 0.8.4 会出错）。

所以我们需要安装 2 个 R 版本。从我的一点了解，如果我们只是使用apt-get upgrade旧版本将被新的取代。我一直在浏览大量文档，但我找不到这样做的最佳方式。

我现在唯一能想到的就是尝试从源代码构建最新的 R，但我的同事对这个想法并不十分热衷，并促使我首先寻找另一种解决方案。我错过了任何信息，或者有人愿意向我展示完成此任务的小技巧吗？如果从源代码构建是解决方案，我想听听任何陷阱或可能的问题。

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4 回答 4

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您可以使用适当的编译标志安装任何软件的不同版本。当您使用 --help 运行配置脚本时，您应该会看到一个查看安装根目录的选项。

看一眼

./configure --help
...
Installation directories:
  --prefix=PREFIX         install architecture-independent files in PREFIX
                          [/usr/local]

因此您可以将 R-2.14 安装到：

/usr/local/R/2.14

您可以将 R-2.12 安装到：

/usr/local/R/2.12

当您启动配置脚本时，请执行以下操作：

./configure --prefix=/usr/local/R/2.14

等等。

于 2011-12-01T15:22:12.803 回答
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正如我在评论中提到的，这在理论上是可能的，就像某些包系列（Emacs、PostgreSQL、...）允许多个并发版本一样。

我现在不能提供这个，因为我们使用/usr/{share,lib}/R了哪些冲突。如果我要做到这一点/usr/{share,lib}/R-$version，然后dpkg-alternatives用来翻转到默认的首选，我们可能会这样做。问题是过渡。此功能由少数用户使用，使用它可能会为大多数用户引入错误，直到它稳定为止。另外，我没有空闲时间（但如果其他人想这样做，请这样做）。

同时，您可以

  1. 可能使用高级功能dpkg并解压到本地目录，而不是下面的默认目录/——所以/opt/R/oldversions/2.12.1应该是可能的。R 甚至可以运行，您需要$RHOME相应地重新定义。

  2. /usr/local如果你真的必须的话，只需构建本地变体

  3. 如果一个特定的 CRAN / 非 CRAN 包声称需要一个特定版本的 R，那么已经修复了该死的包！;-)

最后，这是一个主题，r-sig-debian例如 CRAN 维护者 Michael 和 Johannes 不会在此处阅读此主题。

于 2011-12-01T17:43:19.207 回答
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我认为如果没有提供多个版本的 debian repo，那么如果不从源代码编译 R，就很难保持两个版本的 R 顺利运行。

我经常做的是在我的主目录中安装 R，因为我们的研究所没有给我们 root 权限。要在系统范围内安装 R 的源版本，您可以将其安装在单独的目录中（例如 /opt/R2.14）并使用：

./configure --prefix=/opt/R2.14/

最后一步是创建一个指向 R 二进制文件的符号链接：

ln -s /opt/R2.14/bin/R /usr/bin/R2.14

用户可以启动两个版本的 R（R 和 R2.14）。希望这可以帮助！

于 2011-12-01T15:29:12.103 回答
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确实，从源代码构建 R 非常非常容易（即使我也能做到！），只要您知道首先运行以下命令：

apt-get build-dep r-base

否则您可能会从make. 感谢 Dirk 在过去发布了该宝石。我没有在手册、自述文件或常见问题解答中看到这一点。

然后，它只是：

./configure
make

我想这可能是您需要考虑的：R 使用静态还是动态系统库？与预打包的二进制 R 相比，自建的 R 是否可以链接到不同的库？（我不知道）。你投入多少取决于我猜你的 R 应用程序有多重要，以及哪些系统库对你来说很重要。

于 2011-12-01T16:35:35.090 回答