r - 将 RleViews 转换为矩阵

Question

是否有更快的方法将 RleViews 对象（包含相同长度的元素）转换为矩阵对象？

我通常使用

viewApply(x, as.vector)

天呐！

Answer 1

对于一个可重现的例子

library(IRanges)  ## Bioconductor
rle = Rle(sample(2, 100000, TRUE))
v = successiveViews(rle, rep(5, 1000), gap=10)

然后也许

r = seqselect(rle, start(v), end(v))
matrix(as.integer(r), nrow=5)

如果您提供自己的示例和时间安排，则可以询问这是否是一种改进。

2016 年 7 月 29 日更新

对矩阵的强制可以通过unlist()查看视图和调用矩阵来完成，

matrix(unlist(v), nrow=5)

这部分是因为matrix()将其第一个参数强制为向量。