我正在使用MALLET进行主题分析，它在几千行和一百左右行的文本文件（“topics.txt”）中输出结果，其中每行由制表符分隔的变量组成，如下所示：
Num1 text1 topic1 proportion1 topic2 proportion2 topic3 proportion3, etc.
Num2 text2 topic1 proportion1 topic2 proportion2 topic3 proportion3, etc.
Num3 text3 topic1 proportion1 topic2 proportion2 topic3 proportion3, etc.
这是实际数据的片段：
> dat[1:5,1:10]
V1 V2 V3 V4 V5 V6 V7 V8 V9 V10
1 0 10.txt 27 0.4560785 23 0.3040853 20 0.1315621 21 0.03632624
2 1 1001.txt 20 0.2660085 12 0.2099153 8 0.1699586 13 0.16922928
3 2 1002.txt 16 0.3341721 2 0.1747023 10 0.1360454 12 0.07507119
4 3 1003.txt 12 0.5366148 8 0.2255179 18 0.1388561 0 0.01867091
5 4 1005.txt 16 0.2363206 0 0.2214441 24 0.1914769 7 0.17760521
我正在尝试使用R将此输出转换为数据表，其中主题是列标题，每个主题包含变量“比例”的值，直接位于每个变量“主题”的右侧，每个值'文本'。像这样：
topic1 topic2 topic3
text1 proportion1 proportion2 proportion3
text2 proportion1 proportion2 proportion3
或使用上面的数据片段，如下所示：
0 2 7 8 10 12 13 16 18 20 21 23 24 27
10.txt 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0.1315621 0.03632624 0.3040853 0 0.4560785
1001.txt 0 0 0 0.1699586 0 0.2099153 0.1692292 0 0 0.2660085 0 0 0 0
1002.txt 0 0.1747023 0 0 0.1360454 0.0750711 0 0.3341721 0 0 0 0 0 0
1003.txt 0.0186709 0 0 0.2255179 0 0.5366148 0 0 0.138856 0 0 0 0 0
1005.txt 0.2214441 0 0.1776052 0 0 0 0 0.2363206 0 0 0 0 0.1914769 0
这是我必须完成的工作的R代码，是从朋友那里发来的，但它对我不起作用（而且我对它的了解还不够，无法自己修复）：
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dat<-read.table("topics.txt", header=F, sep="\t")
datnames<-subset(dat, select=2)
dat2<-subset(dat, select=3:length(dat))
y <- data.frame(topic=character(0),proportion=character(0),text=character(0))
for(i in seq(1, length(dat2), 2)){
z<-i+1
x<-dat2[,i:z]
x<-cbind(x, datnames)
colnames(x)<-c("topic","proportion", "text")
y<-rbind(y, x)
}
# Right at this step at the end of the block
# I get this message that may indicate the problem:
# Error in c(in c("topic", "proportion", "text") : unused argument(s) ("text")
y[is.na(y)] <- 0
xdat<-xtabs(proportion ~ text+topic, data=y)
write.table(xdat, file="topicMatrix.txt", sep="\t", eol = "\n", quote=TRUE, col.names=TRUE, row.names=TRUE)
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对于如何使此代码正常工作的任何建议，我将不胜感激。我的问题可能与这个有关，也可能与这个有关，但我还没有能力立即使用这些问题的答案。