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我在geneplotter（Bioconductor包）安装期间。我在 Linux Mint 9 上使用 R 2.14。我认为命名空间对此负责，但我不知道如何修复它......

这是错误：

> source("http://bioconductor.org/biocLite.R")
> biocLite("geneplotter")
BioC_mirror: 'http://www.bioconductor.org'
Using R version 2.14, BiocInstaller version 1.2.0.
Installing package(s) 'geneplotter'
Installing package(s) into ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14’
(as ‘lib’ is unspecified)
essai de l'URL 'http://www.bioconductor.org/packages/2.9/bioc/src/contrib/geneplotter_1.31.4.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 1387616 bytes (1.3 Mb)
URL ouverte
==================================================
downloaded 1.3 Mb

* installing *source* package ‘geneplotter’ ...
** R
** data
** inst
** preparing package for lazy loading
** help
*** installing help indices
** building package indices ...
*** tangling vignette sources ...
   ‘byChroms.Rnw’ 
   ‘visualize.Rnw’ 
** testing if installed package can be loaded
Error in namespaceExport(ns, exports) : 
  undefined exports: .__C__file, .__C__connection
Erreur : le chargement a échoué
Exécution arrêtée
ERREUR : le chargement a échoué
* removing ‘/home/nicolas/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/2.14/geneplotter’

The downloaded packages are in
    ‘/tmp/RtmpO1aY1T/downloaded_packages’
Message d'avis :
In install.packages(pkgs = pkgs, repos = repos, ...) :
  installation of package ‘geneplotter’ had non-zero exit status

提前致谢，

N。

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1 回答 1

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更仔细地研究这一点，geneplotter 未能为初始版本构建。所以你选择的版本是倒数第二个版本。您发现的问题已于昨天得到纠正，及时用于下一个构建周期。geneplotter应该在正确构建时正确安装，可能在 PDT 中午；寻找版本 1.32.1。回想起来，这不是一个 SO 问题；Bioconductor邮件列表有一个不需要订阅的邮寄设施。

于 2011-11-02T14:53:31.677 回答