r - R 热图，Y 轴上的标签非常接近

Question

我正在使用 R 绘制 CSV 文件中数据的热图（10（列）条件和 1000（Rowa））

以下是我正在使用的代码..

nba <- read.csv("1317754115.csv", sep=",")
nba_matrix <- data.matrix(nba)
cexRow = 0.2 + 1/log10(1000),
cexCol = 0.2 + 1/log10(10),
nba_heatmap <- heatmap(nba_matrix, Rowv=cexRow, Colv=cexCol, 
    col = heat.colors(256), scale="column", margins=c(5,10))

热图图像

现在右侧的行非常接近，所以我无法阅读标签名称，

有人可以告诉我如何在 Y 轴上显示所有标签

谢谢

Answer 1

您无法使用基本heatmap功能更改纵横比。要获得此功能，请参阅heatmap.2包gplots中或包aspectHeatmap中ClassDiscovery。这是一个例子：

require(gplots)

nrow = 100
ncol = 10

set.seed(12345)
row.names = replicate(nrow, paste(letters[sample(10)], collapse=''))
col.names = replicate(ncol, paste(letters[sample(10)], collapse=''))

values = matrix(runif(nrow*ncol), nrow=nrow, dimnames=list(row.names, col.names))

dev.new(width=5, height=10)
heatmap(values)
dev.new(width=5, height=10)
heatmap.2(values)